A polyadenylation site variant causes transcript-specific BMP1 deficiency and frequent fractures in children
Notice bibliographique
Résumé
We had previously published the clinical characteristics of a bone fragility disorder in children that was characterized mainly by lower extremity fractures and a mineralization defect in bone tissue but not on the growth plate level. We have now performed whole-exome sequencing on four unrelated individuals with this phenotype. Three individuals were homozygous for a nucleotide change in BMP1, affecting the polyadenylation signal of the transcript that codes for the short isoform of BMP1 (BMP1-1) (c.*241T>C). In skin fibroblasts of these individuals, we found low levels of BMP1-1 transcript and protein. The fourth individual was compound heterozygous for the c.*241T>C variant in BMP1-1 and a variant in BMP1 exon 15 (c.2107G>C) that affected splicing in both BMP1-1 and the long isoform of BMP1 (BMP1-3). Both the homozygous 3'UTR variant and the compound heterozygous variants were associated with impaired procollagen type I C-propeptide cleavage, as the amount of free C-propeptide in the supernatant of skin fibroblasts was less than in controls. Peripheral quantitative computed tomography showed that all individuals had elevated volumetric cortical bone mineral density. Assessment of iliac bone samples by histomorphometry and quantitative backscattered electron imaging indicated that the onset of mineralization at bone formation sites was delayed, but that mineralized matrix was hypermineralized. These results show that isolated lack of BMP1-1 causes bone fragility in children.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».