Association between avian necrotic enteritis and<i>Clostridium perfringens</i>strains expressing NetB toxin
Notice bibliographique
Résumé
A novel toxin, NetB, has recently been identified in virulent avian Clostridium perfringens isolates and shown to be an essential virulence factor in a clinical necrotic enteritis isolate. To assess whether NetB is more generally associated with avian necrotic enteritis isolates we have screened a range of C. perfringens strains from geographically diverse locations for both the presence and expression of the netB gene. Forty-four isolates were derived from necrotic enteritis disease cases from Australia, Belgium, Denmark and Canada and 55 isolates from healthy chickens from Australia and Belgium. The majority of strains isolated from necrotic enteritis-affected birds were netB positive (70%) and there was an absolute correlation between the presence of netB and in vitro expression of the NetB protein. Only two of the C. perfringens isolates from healthy chickens carried netB. Sequencing of the netB gene from 23 positive isolates showed that NetB is highly conserved, with only one predicted amino acid (A168T) difference, in six isolates, compared to the published sequence. This change did not alter the in vitro activity of the NetB toxin. The gene encoding the recently discovered TpeL toxin was also screened using PCR and only found in a small proportion of NetB-positive isolates from diseased birds. A selection of NetB-negative isolates, originating from diseased birds, was unable to cause disease in a necrotic enteritis induction model. This study provides further evidence that NetB is important in pathogenesis and advances our current understanding of C. perfringens virulence factors in avian necrotic enteritis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».