Rapid Detection of <i>Clostridium difficile</i> in Feces by Real-Time PCR
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Clostridium difficile is the major causative agent of nosocomial antibiotic-associated diarrhea, colitis, and pseudomembranous colitis. The pathogenicity of C. difficile is closely related to the production of toxins A and B. Toxigenic C. difficile detection by a tissue culture cytotoxin assay is often considered the "gold standard." However, this assay is time consuming, as it implies an incubation period of at least 24 h. We have developed a rapid real-time fluorescence-based multiplex PCR assay targeting the C. difficile toxin genes tcdA and tcdB, with the Smart Cycler. Two molecular beacons bearing different fluorophores were used as internal probes specific for each amplicon type. The analytical sensitivity of the assay was around 10 genome copies for all nine C. difficile strains tested, representing the 6 most common toxinotypes. The specificity was demonstrated by the absence of amplification with DNA purified from bacterial species other than C. difficile (n = 14), including Clostridium sordellii for which the lethal toxin gene sequence is closely related to the toxin genes of C. difficile. Following a rapid (15 min) and simple fecal sample preparation protocol, both tcdA and tcdB were efficiently amplified from 28 of 29 cytotoxin-positive feces samples. There was no amplification observed with all 27 cytotoxin-negative feces samples tested. This is the first real-time PCR assay for the detection of C. difficile. It is rapid, sensitive, and specific and allows detection of C. difficile directly from feces samples.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle