Meta‐analysis of association between obsessive‐compulsive disorder and the 3′ region of neuronal glutamate transporter gene <i>SLC1A1</i>
Notice bibliographique
Résumé
The neuronal glutamate transporter gene SLC1A1 is a candidate gene for obsessive-compulsive disorder (OCD) based on linkage studies and convergent evidence implicating glutamate in OCD etiology. The 3' end of SLC1A1 is the only genomic region with consistently demonstrated OCD association, especially when analyzing male-only probands. However, specific allele associations have not been consistently replicated, and recent OCD genome-wide association and meta-analysis studies have not incorporated all previously associated SLC1A1 SNPs. To clarify the nature of association between SLC1A1 and OCD, pooled analysis was performed on all available relevant raw study data, comprising a final sample of 815 trios, 306 cases and 634 controls. This revealed weak association between OCD and one of nine tested SLC1A1 polymorphisms (rs301443; uncorrected P = 0.046; non-significant corrected P). Secondary analyses of male-affecteds only (N = 358 trios and 133 cases) demonstrated modest association between OCD and a different SNP (rs12682807; uncorrected P = 0.012; non-significant corrected P). Findings of this meta-analysis are consistent with the trend of previous candidate gene studies in psychiatry and do not clarify the putative role of SLC1A1 in OCD pathophysiology. Nonetheless, it may be important to further examine the potential associations demonstrated in this amalgamated sample, especially since the SNPs with modest associations were not included in the more highly powered recent GWAS or in a past meta-analysis including five SLC1A1 polymorphisms. This study underscores the need for much larger sample sizes in future genetic association studies and suggests that next-generation sequencing may be beneficial in examining the potential role of rare variants in OCD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,011 | 0,018 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,008 | 0,030 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».