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Enregistrement W2129107362 · doi:10.1016/j.ijid.2008.05.448

Screening for C. trachomatis and N. gonorrhoeae Infections by Testing Penile Meatal Swabs and Urine with APTIMA® Combo 2

2008· article· en· W2129107362 sur OpenAlexaff
Max Chernesky, D. Jang, E. Portillo, Marek Smieja

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Infectious Diseases · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensMcMaster UniversitySt. Joseph’s Healthcare Hamilton
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAsymptomaticMedicineUrineMeatusPenisGynecologySurgeryInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Young men are often asymptomatic with C. trachomatis (CT) and/or N. gonorrhoeae (GC), serving as a source of infection and are hesitant to provide urethral swabs. Our objectives were to provide clear instructions for young men to collect meatal swabs and first catch urine (FCU). To determine the performance of a wrapped APTIMA swab (AS, Gen-Probe, Inc.) to a flocked swab (FS, Copan) and measure prevalence of infection according to sample type. Methods: The self-collection method instructed pulling back on the penis shaft to open the meatus and placing in the tip of each swab. The first 20 mL of urine was collected before or after the swab(s). Both the AS and FS were placed into the APTIMA transport tube and all specimens were tested for CT and GC by the APTIMA Combo 2 assay within 48 hours. Results: A total of 511 men (aged 15–25) were enrolled from a youth clinic (80% asymptomatic and 92% uncircumcised). In 293 (group A), the AS was compared to FCU and in 218 (group B), an FCU was compared to an AS and FS. The prevalence of CT and GC infections were 6.8 and 4.4; and 9.1 and 0.4 in the two groups respectively. AS detected 87.5%, FS 85.0% and FCU 82.5% of the CT infections. For GC, the respective values were 100%, 100% and 78.6%. In the swab comparison, both were equal. Slightly more found it easier to collect an FCU and preferred it. Conclusions: Given clear instructions, young men can self collect an MS or FCU for screening. Although a micturition is slightly easier than swabbing, accuracy in getting the first 20 mL of urine may still be a variable in diagnosis. Screening programs should optimize the specimen type and further research should validate the accuracy of the collection component.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
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