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Enregistrement W2129119624 · doi:10.1111/1574-6941.12062

Biodiversity and composition of methanogenic populations in the rumen of cows fed alfalfa hay or triticale straw

2012· article· en· W2129119624 sur OpenAlexaff
Yunhong Kong, Yun Xia, Robert J. Seviour, Robert J. Forster, Tim A. McAllister

Notice bibliographique

RevueFEMS Microbiology Ecology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueAnaerobic Digestion and Biogas Production
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRumenBiologyMethanogenesisHayMicrobial population biologyComposition (language)StrawTriticaleEuryarchaeotaAnimal scienceFood scienceArchaeaBacteriaAgronomyFermentation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

It is clear that methanogens are responsible for ruminal methane emissions, but quantitative information about the composition of the methanogenic community in the bovine rumen is still limited. The diversity and composition of rumen methanogens in cows fed either alfalfa hay or triticale straw were examined using a full-cycle rRNA approach. Quantitative fluorescence in situ hybridization undertaken applying oligonucleotide probes designed here identified five major methanogenic populations or groups in these animals: the Methanobrevibacter TMS group (consisting of Methanobrevibacter thaueri, Methanobrevibacter millerae and Methanobrevibacter smithii), Methanbrevibacter ruminantium-, Methanosphaera stadtmanae-, Methanomicrobium mobile-, and Methanimicrococcus-related methanogens. The TMS- and M. ruminantium-related methanogens accounted for on average 46% and 41% of the total methanogenic cells in liquid (Liq) and solid (Sol) phases of the rumen contents, respectively. Other prominent methanogens in the Liq and Sol phases included members of M. stadtmanae (15% and 33%), M. mobile (17% and 12%), and Methanimicrococcus (23% and 9%). The relative abundances of these methanogens in the community varied among individual animals and across diets. No clear differences in community composition could be observed with dietary change using cloning techniques. This study extends the known biodiversity levels of the methanogenic communities in the rumen of cows.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,744
Score d'incertitude au seuil0,210

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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