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Enregistrement W2129207518 · doi:10.1158/0008-5472.can-07-2113

Potential Use of Quantitative Tissue Phenotype to Predict Malignant Risk for Oral Premalignant Lesions

2008· article· en· W2129207518 sur OpenAlexaff
Martial Guillaud, Lewei Zhang, Catherine F. Poh, Miriam P. Rosin, Calum MacAulay

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesNational Institute of Dental and Craniofacial Research
Mots-clésDysplasiaCarcinoma in situMedicineHyperplasiaEpithelial dysplasiaCancerPathologyOPLSInternal medicineCarcinomaLoss of heterozygosityPhenotypeRelative riskOncologyGastroenterologyBiologyConfidence intervalGeneticsChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The importance of early diagnosis in improving mortality and morbidity rates of oral squamous cell carcinoma (SCC) has long been recognized. However, a major challenge for early diagnosis is our limited ability to differentiate oral premalignant lesions (OPL) at high risk of progressing into invasive SCC from those at low risk. We investigated the potential of quantitative tissue phenotype (QTP), measured by high-resolution image analysis, to identify severe dysplasia/carcinoma in situ (CIS; known to have an increased risk of progression) and to predict progression to cancer within hyperplasia or mild/moderate dysplasia. We generated a nuclear phenotype score (NPS), a combination of five nuclear morphometric features that best discriminate 4,027 "normal" nuclei (selected from 29 normal oral biopsies) from 4,298 "abnormal" nuclei (selected from 30 SCC biopsies). This NPS was then determined for a set of 69 OPLs. Severe dysplasia/CIS showed a significant increase in NPS compared with hyperplasia or mild/moderate dysplasia. However, within the latter group, elevated NPS was strongly associated with the presence of high-risk loss of heterozygosity (LOH) patterns. There was a statistical difference between NPS of hyperplasia or mild/moderate dysplasia that progressed to cancer and those that did not. Individuals with a high NPS had a 10-fold increase in relative risk of progression. In the multivariate Cox model, LOH and NPS together were the strongest predictors for cancer development. These data suggest that QTP could be used to identify lesions that require molecular evaluation and should be integrated with such approaches to facilitate the identification of hyperplasia or mild/moderate dysplasia OPLs at high risk of progression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,219
Tête enseignante GPT0,448
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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