A unique glycosyltransferase involved in the initial assembly of Moraxella catarrhalis lipooligosaccharides
Notice bibliographique
Résumé
Moraxella catarrhalis express three predominant forms of lipooligosaccharide (LOS) molecules on the bacterial surface. These major glycolipids contain specific carbohydrate epitopes that distinguish each glycoform into serotype A, B, or C LOS. All three serotypes, however, share a common glucose containing inner-core structure, consisting of an alpha-glucose attached to 2-keto-3-deoxyoctulosonic acid (KDO), which is unique among Gram-negative bacteria. Many of the LOS glycosyltransferase genes (lgt) responsible for assembly of the extended M. catarrhalis LOS structure have been identified. In this report, we now describe the identification and characterization of Lgt6, a unique glycosyltransferase that is responsible for the addition of the first glucose to the inner core thus initiating the assembly of full length LOS. Isogenic mutants defective in the expression of lgt6 were constructed in all three M. catarrhalis LOS serotypes and the resulting LOS glycoforms consisted of KDO(2)-lipid A-OH as analyzed by urea sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) and mass spectrometry. In addition, the expression of lgt6 in trans in a heptose-deficient Neisseria meningitidis NMB gmhX mutant resulted in the addition of a hexose to the LOS of this strain. These studies demonstrate that Lgt6 functions as an alpha-(1-5)-glucosyltransferase in M. catarrhalis adding the primary glucose to the KDO(2)-lipid A-OH in LOS biosynthesis. The function of Lgt6 is required for the completion of both the major and minor oligosaccharide chains in M. catarrhalis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».