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Enregistrement W2129234968 · doi:10.1139/w03-118

Endophytic bacterial communities of field-grown potato plants and their plant-growth-promoting and antagonistic abilities

2004· article· en· W2129234968 sur OpenAlexvenueno aff
Angela Sessitsch, Birgit Reiter, Gabriele Berg

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversität Rostock
Mots-clésBiologyStenotrophomonasRhizoctonia solaniPhyllosphereSclerotinia sclerotiorumBacteriaStreptomyces16S ribosomal RNAAntibiosisBotanyVerticilliumMicrobiologyErwiniaXanthomonasMicrobacteriumAntagonism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To study the effect of plant growth on potato-associated bacteria, the composition and properties of bacteria colonizing the endosphere of field-grown potato were analyzed by a multiphasic approach. The occurrence and diversity of potato-associated bacteria were monitored by a cultivation-independent approach, using terminal restriction fragment length polymorphism analysis of 16S rDNA. The patterns obtained revealed a high heterogeneity of community composition and suggested the existence of plant-specific communities. However, endophytic populations correlated to a certain extent with plant growth performance. Endophytes were also isolated from plants that grew well or grew poorly and were identified by partial sequencing of the 16S rRNA genes. A broad phylogenetic spectrum was found among isolates and differently growing plants hosted different bacterial populations. In an approach to investigate the plant-growth-promoting potential of potato-associated bacteria, a total of 35 bacteria were screened by dual testing for in vitro antagonism towards (i) the fungal pathogens Verticillium dahliae, Rhizoctonia solani, Sclerotinia sclerotiorum, and Phytophthora cactorum and (ii) the bacterial pathogens Erwinia carotovora, Streptomyces scabies, and Xanthomonas campestris. The proportion of isolates with antagonistic activity was highest against Streptomyces sp. (43%) followed by those against Xanthomonas sp. (29%). As all plants showed more or less severe disease symptoms of scab disease caused by Streptomyces scabies, we assume that the presence of the pathogen induced the colonization of antagonists. The antifungal activity of the isolates was generally low. The biotechnological potential of endophytic isolates assessed by their antagonistic activity and by in vitro production of enzymes, antibiotics, siderophores, and the plant growth hormone indole-1,3-acetic acid was generally high. Overall, seven endophytes were found to antagonize fungal as well as bacterial pathogens and showed a high production of active compounds and were therefore considered promising biological control agents.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,185
Écart entre enseignants0,171 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations374
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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