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Enregistrement W2129295450 · doi:10.1152/ajplung.00214.2010

Increased deposition of chondroitin/dermatan sulfate glycosaminoglycan and upregulation of β1,3-glucuronosyltransferase I in pulmonary fibrosis

2010· article· en· W2129295450 sur OpenAlexafffund
Narayanan Venkatesan, Mohamed Ouzzine, Martin Kolb, Patrick Netter, Mara S. Ludwig

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Lung Cellular and Molecular Physiology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProteoglycans and glycosaminoglycans research
Établissements canadiensMcMaster UniversitySt. Joseph’s Healthcare HamiltonMcGill UniversityChristie (Canada)
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésDermatan sulfateGlycosaminoglycanChemistryPulmonary fibrosisChondroitin sulfateFibrosisVersicanSulfationFibroblastLungDownregulation and upregulationChondroitinTransforming growth factorPathologyBiochemistryEndocrinologyInternal medicineExtracellular matrixProteoglycanMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pulmonary fibrosis (PF) is characterized by increased deposition of proteoglycans (PGs), in particular core proteins. Glycosaminoglycans (GAGs) are key players in tissue repair and fibrosis, and we investigated whether PF is associated with changes in the expression and structure of GAGs as well as in the expression of β1,3-glucuronosyltransferase I (GlcAT-I), a rate-limiting enzyme in GAG synthesis. Lung biopsies from idiopathic pulmonary fibrosis (IPF) patients and lung tissue from a rat model of bleomycin (BLM)-induced PF were immunostained for chondroitin sulfated-GAGs and GlcAT-I expression. Alterations in disaccharide composition and sulfation of chondroitin/dermatan sulfate (CS/DS) were evaluated by fluorophore-assisted carbohydrate electrophoresis (FACE) in BLM rats. Lung fibroblasts isolated from control (saline-instilled) or BLM rat lungs were assessed for GAG structure and GlcAT-I expression. Disaccharide analysis showed that 4- and 6-sulfated disaccharides were increased in the lungs and lung fibroblasts obtained from fibrotic rats compared with controls. Fibrotic lung fibroblasts and transforming growth factor-β(1) (TGF-β(1))-treated normal lung fibroblasts expressed increased amounts of hyaluronan and 4- and 6-sulfated chondroitin, and neutralizing anti-TGF-β(1) antibody diminished the same. TGF-β(1) upregulated GlcAT-I and versican expression in lung fibroblasts, and signaling through TGF-β type I receptor/p38 MAPK was required for TGF-β(1)-mediated GlcAT-I and CS-GAG expression in fibroblasts. Our data show for the first time increased expression of CS-GAGs and GlcAT-I in IPF, fibrotic rat lungs, and fibrotic lung fibroblasts. These data suggest that alterations of sulfation isomers of CS/DS and upregulation of GlcAT-I contribute to the pathological PG-GAG accumulation in PF.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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