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Enregistrement W2129312219 · doi:10.1128/jb.184.23.6437-6447.2002

Impact of Phosphorylation of Specific Residues in the Tyrosine Autokinase, Wzc, on Its Activity in Assembly of Group 1 Capsules in<i>Escherichia coli</i>

2002· article· en· W2129312219 sur OpenAlexaff
Anne Paiment, Jennifer C. Hocking, Chris Whitfield

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTyrosinePhosphorylationBiologyTyrosine phosphorylationBiochemistryProtein tyrosine phosphataseSH2 domain

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Wzc(CPS) is a tyrosine autokinase essential for the assembly of a high-molecular-weight (HMW) group 1 capsular polysaccharide (CPS) in Escherichia coli. Homologues of Wzc participate in the formation of CPS and exopolysaccharides in a variety of gram-positive and gram-negative bacteria. Phosphorylation of tyrosine residues in the Wzc(CPS) C terminus is essential for HMW CPS assembly. Overexpression of Wzb(CPS) (phosphatase) in a wild-type background caused a 3.7-fold decrease in the amount of cell-associated K30 CPS produced, confirming the importance of Wzc(CPS) phosphorylation for capsule assembly. In this study, the tyrosine-rich region was dissected in an attempt to identify residues critical for Wzc(CPS) phosphorylation and/or capsule expression. Site-directed mutagenesis demonstrated that no single tyrosine residue in this region is sufficient for detectable phosphorylation of Wzc(CPS) in vivo or for HMW CPS expression. Furthermore, no single tyrosine residue is essential for phosphorylation or capsule assembly, since removal of any one tyrosine residue has no detectable effect. Altering combinations of tyrosine residues (from two to five) led to Wzc(CPS) derivatives that were still competent for phosphorylation but that could not support assembly of HMW CPS, showing that phosphorylation of Wzc per se is not an accurate measure of its ability to function in capsule assembly. One interpretation of these data is that the overall level of phosphorylation in this region, rather than the precise combination of residues accessible to phosphorylation, is important for the activity of Wzc(CPS). Tyrosine 569, a residue shown to modulate the in vitro phosphorylation of Wzc(CA) from E. coli K-12, was also mutated. The derivative with this mutation still functioned in capsule assembly. Quantitation of K30(CPS) from this mutant revealed no difference in the amount of polymer produced. Finally, dithiobis(succinimidylpropionate) cross-linking was used to confirm that Wzc(CPS) forms complexes in vivo, independent of the phosphorylation state of the protein.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,643
Score d'incertitude au seuil0,302

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations114
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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