MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2129324791 · doi:10.2174/1875036201408010016

Predicting Neutropenia Risk in Breast Cancer Patients from Pre-Chemotherapy Characteristics

2014· article· en· W2129324791 sur OpenAlexaff
Sodiq Kolawole Lawal, Michael J. Korenberg, Natalia Pittman, Mihaela Mates

Notice bibliographique

RevueThe Open Bioinformatics Journal · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeutropenia and Cancer Infections
Établissements canadiensKingston General HospitalQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFebrile neutropeniaMedicineOdds ratioNeutropeniaBreast cancerInternal medicineChemotherapyCancerSurgeryOncology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A previous study (Pittman, Hopman, Mates) of breast cancer patients undergoing curative chemotherapy (CT) found that the third most common reason for emergency department (ER) visits and hospital admission (HA) was febrile neutropenia. Factors associated with ER visits and HA included (1) stage of the cancer, (2) size of tumor, (3) adjuvant versus neo-adjuvant CT (“adjuvance”), and (4) number of CT cycles. We hypothesized that a statistically-significant predictor of neutropenia could be built based on some of these factors, so that risk of neutropenia predicted for a patient feeling unwell during CT could be used in weighing need to visit the ER. The number of CT cycles was not used as a factor so that the predictor could calculate the neutropenia risk for a patient before the first CT cycle. Different models were built corresponding to different pre-chemotherapy factors or combinations of factors. The single factor yielding the best classification accuracy was tumor size (Mathews’ correlation coefficient φ = +0.18, Fisher’s exact two-tailed probability P < 0.0374). The odds ratio of developing febrile neutropenia for the predicted high-risk group compared to the predicted low-risk group was 5.1875. Combining tumor size with adjuvance yielded a slightly more accurate predictor (Mathews’ correlation coefficient φ = +0.19, Fisher’s exact two-tailed probability P < 0.0331, odds ratio = 5.5093). Based on the observed odds ratios, we conclude that a simple predictor of neutropenia may have value in deciding whether to recommend an ER visit. The predictor is sufficiently fast that it can run conveniently as an Applet on a mobile computing device.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Open Bioinformatics JournalMême sujetNeutropenia and Cancer InfectionsTravaux en français237 207