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Enregistrement W2129397798 · doi:10.1093/bioinformatics/btv279

Data Safe Havens in health research and healthcare

2015· review· en· W2129397798 sur OpenAlexafffund
Paul R. Burton, Madeleine J. Murtagh, Andy Boyd, James Williams, Edward S. Dove, Susan Wallace, Anne-Marie Tassé, Julian Little, Rex L. Chisholm, Amadou Gaye, Kristian Hveem, Anthony J. Brookes, P. M. Goodwin, Jon Fistein, Martin Bobrow, Bartha Maria Knoppers

Notice bibliographique

RevueBioinformatics · 2015
Typereview
Langueen
DomaineHealth Professions
ThématiqueElectronic Health Records Systems
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversity of OttawaUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesEconomic and Social Research CouncilMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchNational Cancer InstituteCancer Research UKWellcome Trust
Mots-clésContext (archaeology)Health careInterpretation (philosophy)Health informaticsCorporate governanceData governanceComputer scienceBiomedicinePublic relationsData scienceWork (physics)TrustworthinessKnowledge managementInternet privacyPolitical scienceBusinessData qualityLawEngineeringService (business)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MOTIVATION: The data that put the 'evidence' into 'evidence-based medicine' are central to developments in public health, primary and hospital care. A fundamental challenge is to site such data in repositories that can easily be accessed under appropriate technical and governance controls which are effectively audited and are viewed as trustworthy by diverse stakeholders. This demands socio-technical solutions that may easily become enmeshed in protracted debate and controversy as they encounter the norms, values, expectations and concerns of diverse stakeholders. In this context, the development of what are called 'Data Safe Havens' has been crucial. Unfortunately, the origins and evolution of the term have led to a range of different definitions being assumed by different groups. There is, however, an intuitively meaningful interpretation that is often assumed by those who have not previously encountered the term: a repository in which useful but potentially sensitive data may be kept securely under governance and informatics systems that are fit-for-purpose and appropriately tailored to the nature of the data being maintained, and may be accessed and utilized by legitimate users undertaking work and research contributing to biomedicine, health and/or to ongoing development of healthcare systems. RESULTS: This review explores a fundamental question: 'what are the specific criteria that ought reasonably to be met by a data repository if it is to be seen as consistent with this interpretation and viewed as worthy of being accorded the status of 'Data Safe Haven' by key stakeholders'? We propose 12 such criteria. CONTACT: paul.burton@bristol.ac.uk.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,257
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,327
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Science ouverte
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Reproductibilité · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,992
Score d'incertitude au seuil0,916

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2570,327
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,004
Bibliométrie0,0110,016
Études des sciences et des technologies0,0070,074
Communication savante0,0300,056
Science ouverte0,0080,028
Intégrité de la recherche0,0200,019
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,780
Tête enseignante GPT0,655
Écart entre enseignants0,126 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
DomaineReproductibilité
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations75
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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