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Enregistrement W2129416840 · doi:10.1073/pnas.0602073103

The C2H2 zinc-finger protein SYD-9 is a putative posttranscriptional regulator for synaptic transmission

2006· article· en· W2129416840 sur OpenAlexaff
Ying Wang, Elena O. Gracheva, Janet E. Richmond, Taizo Kawano, Jillian M. Couto, John A. Calarco, Vijhee Vijayaratnam, Yishi Jin, Mei Zhen

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of Mental Health
Mots-clésBiologyNeurotransmissionSynaptic vesicleCell biologyEndocytosisSynapseSynaptic vesicle recyclingAlternative splicingCaenorhabditis elegansZinc fingerSignal transducing adaptor proteinGene isoformNeuroscienceVesicleSignal transductionGeneBiochemistryReceptorTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Communication between neurons is largely achieved through chemical synapses, where neurotransmitters are released from synaptic vesicles at presynaptic terminals to activate postsynaptic cells. Exo- and endocytosis are coordinated to replenish the synaptic vesicle pool for sustained neuronal activity. We identified syd-9 (syd, synapse defective), a gene that encodes multiple C2H2 zinc-finger domain-containing proteins specifically required for synaptic function in Caenorhabditis elegans. syd-9 loss-of-function mutants exhibit locomotory defects, a diffuse distribution of synaptic proteins, and decreased synaptic transmission with unaffected neurodevelopment. syd-9 mutants share phenotypic and ultrastructural characteristics with mutants that lack synaptic proteins that are required for endocytosis. syd-9 mutants also display genetic interactions with these endocytotic mutants, suggesting that SYD-9 regulates endocytosis. SYD-9 proteins are enriched in the nuclei of both neuron and muscle cells, but their neuronal expression plays a major role in locomotion. SYD-9 isoforms display a speckle-like expression pattern that is typical of RNA-binding proteins that regulate premRNA splicing. Furthermore, syd-9 functions in parallel with unc-75 (unc, uncoordinated), the C. elegans homologue of the CELF/BrunoL family protein that regulates mRNA alternative splicing and processing, and is also required specifically for synaptic transmission. We propose that neuronal SYD-9 proteins are previously uncharacterized and specific posttranscriptional regulators of synaptic vesicle endocytosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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