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Enregistrement W2129452863 · doi:10.1111/j.1365-313x.2004.02052.x

The <i>Arabidopsis</i> transcription factor HY5 integrates light and hormone signaling pathways

2004· article· en· W2129452863 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueThe Plant Journal · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLight effects on plants
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésAuxinArabidopsisTranscription factorMutantBiologyCell biologySignal transductionPhenotypePlant hormoneGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The role of the Arabidopsis transcription factor LONG HYPOCOTYL 5 (HY5) in promoting photomorphogenic development has been extensively characterized. Although the current model for HY5 action largely explains its role in this process, it does not adequately address the root phenotype observed in hy5 mutants. In our search for common mechanisms underlying all hy5 traits, we found that they are partly the result of an altered balance of signaling through the plant hormones auxin and cytokinin. hy5 mutants are resistant to cytokinin application, and double mutant analyses indicate that a decrease in auxin signaling moderates hy5 phenotypes. Microarray analyses and semiquantitative RT-PCR indicate that two negative regulators of auxin signaling, AUXIN RESISTANT 2 (AXR2)/INDOLE ACETIC ACID 7 (IAA7) and SOLITARY ROOT (SLR)/IAA14, are underexpressed in hy5 mutants. The promoters of these genes contain a putative HY5 binding site, and in line with this observation, HY5 can bind to the promoter of AXR2 in vitro. Increased AXR2 expression in a hy5 background partially rescues the elongated hypocotyl phenotype. In summary, it appears that auxin signaling is elevated in hy5 mutants because HY5 promotes the expression of negative regulators of auxin signaling, thereby linking hormone and light signaling pathways.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,176
Score d'incertitude au seuil0,750

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,182
Écart entre enseignants0,160 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle