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Enregistrement W2129517158 · doi:10.1094/pdis-12-13-1259-pdn

First Report of White Blister Rust Caused by <i>Albugo candida</i> on Wasabi in Korea

2014· article· en· W2129517158 sur OpenAlexaboutno aff
Young‐Joon Choi, Kyung Sook Han, Y. H. Park, Hyeon‐Dong Shin

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogens and Resistance
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSporangiumBiologyBotanyRust (programming language)HyalineSpotsCropBrassicaceaeBipolarisPedicelBlack spotWhite (mutation)SporeHorticultureAgronomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Wasabi (Wasabia japonica (Miq.) Matsum.), a member of the Brassicaceae family, is a commercially important crop in East Asian countries such as China, Japan, Korea, and Taiwan. In Korea, wasabi is under commercial development since it has become popular as a condiment due to its strong pungent constituents. In May 2013, wasabi plants showing typical symptoms of white blister rust disease were first observed in plastic greenhouses in Taebaek City, Korea. Leaves of infected plants had whitish sori on the lower surfaces and chlorotic blotches on the corresponding upper leaf surfaces. Later, sori changed to creamy to light tan with necrosis of leaf lesion. New infections might occur anytime during the growing season. A representative sample was deposited in the Korea University Herbarium (KUS-F27596). Microscopic examination of fresh materials was performed under a light microscope. The grouped sporangiophores were hyaline, clavate or cylindric, and measured 20 to 35 × 10 to 14 μm. The sporangia were arranged in basipetal chains, hyaline, globose to subglobose, with uniform wall thickness and measured 16 to 21 × 13 to 18 μm. The primary sporangia were morphologically similar to the secondary sporangia, although the former exhibited a slightly thicker wall than the latter. No resting organs were observed. Previously, the white blister rust pathogen on wasabi has been considered either Albugo candida or A. wasabiae, although the latter name is often considered a synonym of A. candida. Based on the morphological characteristics and the specific host plant, the causal agent of this disease was identified as A. candida (2). To confirm this morphological identification, genomic DNA was extracted from infected plant tissue, and the amplification and sequencing of the internal transcribed spacer (ITS) region of rDNA of the Korean specimen were performed using procedures outlined by Choi et al. (1), with oomycete-specific primer set, DC6 and LR0. The resulting 835-bp sequence of the region was deposited in GenBank (Accession No. KF887494). Since this was the first ITS sequence submitted for A. candida on wasabi, comparable data were not available. A comparison with the ITS sequences available in the GenBank database revealed that it is identical to A. candida found on Capsella bursa-pastoris (AF271231), and shows a high similarity of 99% with many A. candida sequences originating from other brassicaceous plants. Therefore, the pathogen found in Korea was confirmed to be A. candida. In Korea, it has been reported that A. candida attacks Brassica juncea, B. campestris subsp. penikensis, and B. napus (3), but to our knowledge this is the first record of A. candida on wasabi (4). The white blister rust caused by A. candida is one of the most devastating diseases of wasabi in Japan and Taiwan where the crop is widely cultivated. On the other hand, in the United States, Canada, and New Zealand, where wasabi is a new crop on a commercial scale, there is no record of this disease. These facts taken together suggest that wasabi white blister rust be not only currently spreading in East Asia, but it also poses a new and serious threat to production of this crop in countries in which it is currently absent. References: (1) Y. J. Choi et al. Mol. Phylogenet. Evol. 40:400, 2006. (2) Y. J. Choi et al. Fungal Divers. 27:11, 2007. (3) Y. J. Choi et al. Plant Pathol. J. 27: 192, 2011. (4) D. F. Farr and A. Y. Rossman. Fungal Databases. Syst. Mycol. Microbiol. Lab., Online publication, ARS, USDA, Retrieved November 15, 2013.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,184
Écart entre enseignants0,174 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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