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Enregistrement W2129597370 · doi:10.1242/dev.006544

β-catenin/TCF/Lef controls a differentiation-associated transcriptional program in renal epithelial progenitors

2007· article· en· W2129597370 sur OpenAlexaff
Kai M. Schmidt‐Ott, T. Néstor H. Masckauchán, Xia Chen, Benjamin J. Hirsh, Abby Sarkar, Jun Yang, Neal Paragas, Valerie A. Wallace, Daniel Dufort, Paul Pavlidis, Bernd Jagla, Jan Kitajewski, Jonathan Barasch

Notice bibliographique

RevueDevelopment · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRenal and related cancers
Établissements canadiensRoyal Victoria HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases
Mots-clésBiologyWNT4Progenitor cellCell biologyMesenchymeWnt signaling pathwayCellular differentiationBeta-cateninTranscription factorEmbryonic stem cellProgenitorMesodermCateninStem cellMolecular biologyMesenchymal stem cellSignal transductionGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In the embryonic kidney, progenitors in the metanephric mesenchyme differentiate into specialized renal epithelia in a defined sequence characterized by the formation of cellular aggregates, conversion into polarized epithelia and segmentation along a proximal-distal axis. This sequence is reiterated throughout renal development to generate nephrons. Here, we identify global transcriptional programs associated with epithelial differentiation utilizing an organ culture model of rat metanephric mesenchymal differentiation, which recapitulates the hallmarks of epithelialization in vivo in a synchronized rather than reiterative fashion. We observe activation of multiple putative targets of beta-catenin/TCF/Lef-dependent transcription coinciding with epithelial differentiation. We show in cultured explants that isolated activation of beta-catenin signaling in epithelial progenitors induces, in a TCF/Lef-dependent manner, a subset of the transcripts associated with epithelialization, including Pax8, cyclin D1 (Ccnd1) and Emx2. This is associated with anti-apoptotic and proliferative effects in epithelial progenitors, whereas cells with impaired TCF/Lef-dependent transcription are progressively depleted from the epithelial lineage. In vivo, TCF/Lef-responsive genes comprise a conserved transcriptional program in differentiating renal epithelial progenitors and beta-catenin-containing transcriptional complexes directly bind to their promoter regions. Thus, beta-catenin/TCF/Lef-mediated transcriptional events control a subset of the differentiation-associated transcriptional program and thereby participate in maintenance, expansion and stage progression of the epithelial lineage.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,383
Score d'incertitude au seuil0,523

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations89
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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