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Enregistrement W2129623226 · doi:10.1093/treephys/28.7.1059

Spatial and temporal expression profiling of cell-wall invertase genes during early development in hybrid poplar

2008· article· en· W2129623226 sur OpenAlexafffund
Thomas Canam, Sunny Mak, Shawn D. Mansfield

Notice bibliographique

RevueTree Physiology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant nutrient uptake and metabolism
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésInvertaseBiologyCell wallPhloemDormancyApoplastBotanyLycopersiconGeneXylemDaucus carotaBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cell-wall invertase genes are spatially and temporally regulated in several plant species, including Daucus carota L., Lycopersicon esculentum L. and Solanum tuberosum L. However, few studies of cell-wall invertase genes of trees have been conducted, despite the importance of trees as a source of lignocellulosic biopolymers. We identified three putative cell-wall invertase genes in hybrid poplar (Populus alba L. x grandidentata Michx.) that showed higher homology to each other than to cell-wall invertases of other dicotyledonous species, with two of the genes (PaxgINV2 and PaxgINV3) appearing as a genomic tandem repeat. These genes are more similar to each other than to tandemly repeated cell-wall invertases of other plants, perhaps indicating parallel evolution of a duplication event with cell-wall invertases in dicotyledons. Spatial and temporal expression analyses throughout a complete annual cycle indicated that PaxgINV1 and PaxgINV2 are highly regulated in vegetative tissues during three distinct growth phases: early growth, dormancy and post-dormancy. Expression of the third gene (PaxgINV3) appears to be tightly regulated and may represent a floral-specific cell-wall invertase. Of the two genes expressed in vegetative tissues, PaxgINV1 appears to be exclusively involved in processes related to dormancy, whereas PaxgINV2 appears to encode an enzyme involved in phloem unloading and in providing actively growing tissues, such as developing xylem, with the energy and carbon skeletons necessary for respiration and cell wall biosynthesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,385
Score d'incertitude au seuil0,174

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,174 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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