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Enregistrement W2129630264 · doi:10.1074/jbc.m402664200

NCB5OR Is a Novel Soluble NAD(P)H Reductase Localized in the Endoplasmic Reticulum

2004· article· en· W2129630264 sur OpenAlexfundno aff
Hao Zhu, Kevin Larade, Timothy A. Jackson, Jianxin Xie, Annie Ladoux, H. Acker, Utta Berchner‐Pfannschmidt, Joachim Fandrey, Andrew R. Cross, Gudrun S. Lukat-Rodgers, Kenton R. Rodgers, H. Franklin Bunn

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMethemoglobinemia and Tumor Lysis Syndrome
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institutes of HealthNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaHerman Frasch Foundation for Chemical ResearchDeutsche ForschungsgemeinschaftJuvenile Diabetes Research Foundation InternationalInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleU.S. Department of Agriculture
Mots-clésCytochrome b5NAD+ kinaseBiochemistryEndoplasmic reticulumChemistryReductaseCytochromeBiologyEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The NAD(P)H cytochrome b5 oxidoreductase, Ncb5or (previously named b5+b5R), is widely expressed in human tissues and broadly distributed among the animal kingdom. NCB5OR is the first example of an animal flavohemoprotein containing cytochrome b5 and chrome b5 reductase cytodomains. We initially reported human NCB5OR to be a 487-residue soluble protein that reduces cytochrome c, methemoglobin, ferricyanide, and molecular oxygen in vitro. Bioinformatic analysis of genomic sequences suggested the presence of an upstream start codon. We confirm that endogenous NCB5OR indeed has additional NH2-terminal residues. By performing fractionation of subcellular organelles and confocal microscopy, we show that NCB5OR colocalizes with calreticulin, a marker for endoplasmic reticulum. Recombinant NCB5OR is soluble and has stoichiometric amounts of heme and flavin adenine dinucleotide. Resonance Raman spectroscopy of NCB5OR presents typical signatures of a six-coordinate low-spin heme similar to those found in other cytochrome b5 proteins. Kinetic measurements showed that full-length and truncated NCB5OR reduce cytochrome c actively in vitro. However, both full-length and truncated NCB5OR produce superoxide from oxygen with slow turnover rates: kcat = approximately 0.05 and approximately 1 s(-1), respectively. The redox potential at the heme center of NCB5OR is -108 mV, as determined by potentiometric titrations. Taken together, these data suggest that endogenous NCB5OR is a soluble NAD(P)H reductase preferentially reducing substrate(s) rather than transferring electrons to molecular oxygen and therefore not an NAD(P)H oxidase for superoxide production. The subcellular localization and redox properties of NCB5OR provide important insights into the biology of NCB5OR and the phenotype of the Ncb5or-null mouse.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil0,582

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations51
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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