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Enregistrement W2129670814 · doi:10.1002/humu.21150

<i>OBSL1</i>mutations in 3-M syndrome are associated with a modulation of<i>IGFBP2</i>and<i>IGFBP5</i>expression levels

2009· article· en· W2129670814 sur OpenAlexaff
Céline Huber, Mélanie Fradin, Thomas Édouard, Martine Le Merrer, Yasemin Alanay, Daniela Bezerra Da Silva, Albert David, Hanan Hamamy, Liselotte van Hest, Allan M. Lund, Jacques L. Michaud, Christine Oley, Chirag Patel, Anna Rajab, David Skidmore, Helen Stewart, M. Tauber, Arnold Münnich, Valérie Cormier‐Daire

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensDalhousie UniversityCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGeneticsMissense mutationLocus (genetics)GeneCandidate geneNonsense-mediated decayGene expressionMicroarray analysis techniquesMicroarrayMolecular biologyMutationRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

3-M syndrome is an autosomal recessive disorder characterized by severe pre- and postnatal growth retardation and minor skeletal changes. We have previously identified CUL7 as a disease-causing gene but we have also provided evidence of genetic heterogeneity in the 3-M syndrome. By homozygosity mapping in two inbred families, we found a second disease locus on chromosome 2q35-36.1 in a 5.2-Mb interval that encompasses 60 genes. To select candidate genes, we performed microarray analysis of cultured skin fibroblast RNA from one patient, looking for genes with altered expression; we found decreased expression of IGFBP2 and increased expression of IGFBP5. However, direct sequencing of these two genes failed to detect any anomaly. We then considered other candidate genes by their function/location and found nine distinct mutations in the OBSL1 gene in 13 families including eight nonsense and one missense mutations. To further understand the links between OBSL1, CUL7, and insulin-like growth factor binding proteins (IGFBPs), we performed real-time quantitative PCR (RT-PCR) analysis for OBSL1, CUL7, IGFBP2, and IGFBP5, using cultured fibroblast RNAs from two patients with distinct OBSL1 mutations (p.F697G; p.H814RfsX15). We found normal CUL7 mRNA levels but abnormal IGFBP2 and IGFBP5 mRNA levels in the two patients, suggesting that OBSL1 modulates the expression of IGFBP proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,724
Score d'incertitude au seuil0,488

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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