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Enregistrement W2129691431 · doi:10.1136/jmedgenet-2013-101658

Phenotype and genotype in 101 males with X-linked creatine transporter deficiency

2013· article· en· W2129691431 sur OpenAlexaff
Jiddeke M. van de Kamp, Ofir T. Betsalel, Saadet Mercimek‐Mahmutoglu, Lara Abulhoul, Stephanie Grünewald, Irina Anselm, Hatem Azzouz, Drago Bratkovic, Arjan de Brouwer, Ben C.J. Hamel, Tjitske Kleefstra, Helger G. Yntema, Jaume Campistol, Marta Vilaseca, David Cheillan, Marc D’Hooghe, Luísa Diogo, Paula Garcia, Carla Valongo, Maria José Fonseca, Suzanna G.M. Frints, Bridget Wilcken, Sigrun von der Haar, Hanne Meijers‐Heijboer, Floris C. Hofstede, Diana Johnson, Sarina G. Kant, Laurence Lion‐François, G. Pitelet, Nicola Longo, J A Maat-Kievit, João Monteiro, Arnold Münnich, Ania C. Muntau, Marie‐Cécile Nassogne, Hitoshi Osaka, Katrin Õunap, Jean-Marc Pinard, Susana Quijano‐Roy, Imke Poggenburg, Nicola Poplawski, Omar Abdul‐Rahman, Antònia Ribes, Ángela Arias, Joy Yaplito‐Lee, Andreas Schulze, Charles E. Schwartz, Susanne Schwenger, G. Soares, Yves Sznajer, Vassili Valayannopoulos, Hilde Van Esch, Stephan Waltz, Mirjam M. C. Wamelink, Petra J. W. Pouwels, Abdellatif Errami, Marjo S. van der Knaap, C. Jakobs, Grazia M.S. Mancini, Gajja S. Salomons

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle metabolism and nutrition
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCreatineGenotypeMissense mutationGeneticsPhenotypeGenotype-phenotype distinctionIntellectual disabilityMedicineGene mutationEpilepsyMutationInternal medicineBiologyEndocrinologyGenePsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Creatine transporter deficiency is a monogenic cause of X-linked intellectual disability. Since its first description in 2001 several case reports have been published but an overview of phenotype, genotype and phenotype--genotype correlation has been lacking. METHODS: We performed a retrospective study of clinical, biochemical and molecular genetic data of 101 males with X-linked creatine transporter deficiency from 85 families with a pathogenic mutation in the creatine transporter gene (SLC6A8). RESULTS AND CONCLUSIONS: Most patients developed moderate to severe intellectual disability; mild intellectual disability was rare in adult patients. Speech language development was especially delayed but almost a third of the patients were able to speak in sentences. Besides behavioural problems and seizures, mild to moderate motor dysfunction, including extrapyramidal movement abnormalities, and gastrointestinal problems were frequent clinical features. Urinary creatine to creatinine ratio proved to be a reliable screening method besides MR spectroscopy, molecular genetic testing and creatine uptake studies, allowing definition of diagnostic guidelines. A third of patients had a de novo mutation in the SLC6A8 gene. Mothers with an affected son with a de novo mutation should be counselled about a recurrence risk in further pregnancies due to the possibility of low level somatic or germline mosaicism. Missense mutations with residual activity might be associated with a milder phenotype and large deletions extending beyond the 3' end of the SLC6A8 gene with a more severe phenotype. Evaluation of the biochemical phenotype revealed unexpected high creatine levels in cerebrospinal fluid suggesting that the brain is able to synthesise creatine and that the cerebral creatine deficiency is caused by a defect in the reuptake of creatine within the neurones.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations165
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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