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Enregistrement W2129813704 · doi:10.2196/jmir.2102

FluBreaks: Early Epidemic Detection from Google Flu Trends

2012· article· en· W2129813704 sur OpenAlexfundno aff
Fahad Pervaiz, Mansoor Pervaiz, Nabeel Abdur Rehman, Umar Saif

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Internet Research · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueData-Driven Disease Surveillance
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesYork UniversityUniversity of Michigan
Mots-clésDisease controlMedicineDisease surveillanceBaseline (sea)Service (business)Public health surveillanceEpidemic diseaseBird fluDiseaseGeographyDemographyMedical emergencyEnvironmental healthPublic healthVirologyBusinessPolitical science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The Google Flu Trends service was launched in 2008 to track changes in the volume of online search queries related to flu-like symptoms. Over the last few years, the trend data produced by this service has shown a consistent relationship with the actual number of flu reports collected by the US Centers for Disease Control and Prevention (CDC), often identifying increases in flu cases weeks in advance of CDC records. However, contrary to popular belief, Google Flu Trends is not an early epidemic detection system. Instead, it is designed as a baseline indicator of the trend, or changes, in the number of disease cases. OBJECTIVE: To evaluate whether these trends can be used as a basis for an early warning system for epidemics. METHODS: We present the first detailed algorithmic analysis of how Google Flu Trends can be used as a basis for building a fully automated system for early warning of epidemics in advance of methods used by the CDC. Based on our work, we present a novel early epidemic detection system, called FluBreaks (dritte.org/flubreaks), based on Google Flu Trends data. We compared the accuracy and practicality of three types of algorithms: normal distribution algorithms, Poisson distribution algorithms, and negative binomial distribution algorithms. We explored the relative merits of these methods, and related our findings to changes in Internet penetration and population size for the regions in Google Flu Trends providing data. RESULTS: Across our performance metrics of percentage true-positives (RTP), percentage false-positives (RFP), percentage overlap (OT), and percentage early alarms (EA), Poisson- and negative binomial-based algorithms performed better in all except RFP. Poisson-based algorithms had average values of 99%, 28%, 71%, and 76% for RTP, RFP, OT, and EA, respectively, whereas negative binomial-based algorithms had average values of 97.8%, 17.8%, 60%, and 55% for RTP, RFP, OT, and EA, respectively. Moreover, the EA was also affected by the region's population size. Regions with larger populations (regions 4 and 6) had higher values of EA than region 10 (which had the smallest population) for negative binomial- and Poisson-based algorithms. The difference was 12.5% and 13.5% on average in negative binomial- and Poisson-based algorithms, respectively. CONCLUSIONS: We present the first detailed comparative analysis of popular early epidemic detection algorithms on Google Flu Trends data. We note that realizing this opportunity requires moving beyond the cumulative sum and historical limits method-based normal distribution approaches, traditionally employed by the CDC, to negative binomial- and Poisson-based algorithms to deal with potentially noisy search query data from regions with varying population and Internet penetrations. Based on our work, we have developed FluBreaks, an early warning system for flu epidemics using Google Flu Trends.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0080,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,003
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,080
Tête enseignante GPT0,440
Écart entre enseignants0,359 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations103
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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