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Enregistrement W2129906956 · doi:10.1139/w07-077

Menaquinone reduction by an HMT2-like sulfide dehydrogenase from Bacillus stearothermophilus

2007· article· en· W2129906956 sur OpenAlexvenueno aff
Hiroomi Shibata, Kuniyuki Suzuki, Shigeki Kobayashi

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism and Genetic Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSulfideChemistryFumarate reductaseBiochemistryCyanideEscherichia coliBacteriaHeminDehydrogenaseEnzymeBiologySuccinate dehydrogenaseInorganic chemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The gene-encoding HMT2-like sulfide dehydrogenase from Bacillus stearothermophilus JCM2501 was amplified and expressed in Escherichia coli and the enzymatic features were examined. The enzyme was detected mainly in the membrane fraction. It catalyzed the sulfide-dependent menaquinone (MK) reduction showing special enzymatic features distinct from other sulfide-quinone oxidoreductases (SQRs) from autotrophic bacteria. The purified protein from E. coli brought about the sulfide-dependent 2,3-dimethyl-1,4-naphthoquinone (DMN) reduction in vitro. The reduction was accelerated in the presence of either cyanide or 2-mercaptoethanol and phospholipids. The high reduction was followed by a change in Km values for sulfide and DMN. The purified enzyme utilized MK as an electron acceptor in the membrane fraction from E. coli. Under anaerobic conditions, sulfide was oxidized with reduction of fumarate or nitrate via the MK pool. The dehydrogenase was different from SQR in autotrophic bacteria in terms of the low affinity for sulfide and the activity enhancement in the presence of cyanide or 2-mercaptoethanol. The sulfide oxidation via MK in the cellular membrane of Gram-positive bacteria was certified.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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