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Enregistrement W2130043670 · doi:10.1128/jcm.00427-10

Impact of Strain Type on Detection of Toxigenic <i>Clostridium difficile:</i> Comparison of Molecular Diagnostic and Enzyme Immunoassay Approaches

2010· article· en· W2130043670 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensJewish General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésClostridium difficileImmunoassayGlutamate dehydrogenaseMicrobiologyClostridioidesClostridiaceaeMedicineRibotypingVirologyBiologyPolymerase chain reactionInternal medicineAntibioticsImmunologyToxinAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A multicenter clinical trial assessed the performance of the Cepheid Xpert C. difficile assay on stool specimens collected from patients suspected of having Clostridium difficile infection (CDI). A total of 2,296 unformed stool specimens, collected from seven study sites, were tested by Xpert C. difficile enrichment culture followed by cell culture cytotoxicity testing of the isolates (i.e., toxigenic culture with enrichment) and the study sites' standard C. difficile test methods. The methods included enzyme immunoassay (EIA), direct cytotoxin testing, and two- and three-step algorithms using glutamate dehydrogenase (GDH) screening followed by either EIA or EIA and an in-house PCR assay. All C. difficile strains were typed by PCR-ribotyping. Compared to results for toxigenic culture with enrichment, the sensitivity, specificity, and positive and negative predictive values of the Xpert assay were 93.5, 94.0, 73.0, and 98.8%, respectively. The overall sensitivity of the EIAs compared to that of enrichment culture was 60.0%, and the sensitivity of combined GDH algorithms was 72.9%; both were significantly lower than that of Xpert C. difficile (P < 0.001 and P = 0.03, respectively). The sensitivity of the EIA was significantly lower than that of the Xpert C. difficile assay for detection of ribotypes 002, 027, and 106 (P < 0.0001, P < 0.0001, and P = 0.004, respectively, Fisher's exact test), and the sensitivity of GDH algorithms for ribotypes other than 027 was lower than that for Xpert C. difficile (P < 0.001). The Xpert C. difficile assay is a simple, rapid, and accurate method for detection of toxigenic C. difficile in unformed stool specimens and is minimally affected by strain type compared to EIA and GDH-based methods.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,640

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,071
Tête enseignante GPT0,399
Écart entre enseignants0,328 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle