Interaction of acyl carrier protein with enzyme partners: insights from fluorescence
Notice bibliographique
Résumé
Acyl carrier protein (ACP) is a natively unfolded protein that undergoes reversible conformational change as it shuttles fatty acyl groups among a variety of enzymes in the synthesis of bacterial lipids and other products. Folding of ACP upon divalent cation binding or fatty acylation has previously been monitored by intrinsic Trp fluorescence of ACP mutant L46W. In the present study, we found that interaction with UDP‐GlcNAc acyltransferase (LpxA) produced a large fluorescence blue shift of L46W, indicating that ACP also folds upon LpxA binding. LpxA (but not Mg 2+ ) caused a smaller blue shift of mutant A45W, suggesting that this residue may be involved directly in enzyme interaction. Based on Trp fluorescence, LpxA interacted preferentially with holo‐ vs apo‐ACP, while the opposite was true for holo‐ACP synthase (AcpS). Titration with LpxA also caused a 2‐fold increase in fluorescence intensity of ACP labeled with AEDANS at the phosphopantetheine sulfhydryl group (apparent K d of 2 μM). Addition of Mg 2+ reversed this LpxA‐induced fluorescence increase, suggesting that binding of LpxA and divalent cations to ACP results in different phosphopantetheine environments. Fluorescence thus provides insight into the binding and conformational changes that accompany ACP interaction with partner enzymes ( supported by CIHR and NSERC ).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».