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Enregistrement W2130157754 · doi:10.1136/gut.2007.143172

The significance of the gut barrier in disease: Figure 1

2008· review· en· W2130157754 sur OpenAlexaff
Jon Meddings

Notice bibliographique

RevueGut · 2008
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDiseaseInflammatory bowel diseaseUlcerative colitisImmunologyContext (archaeology)Immune systemBarrier functionInflammationGastrointestinal tractIntestinal mucosaAcquired immune systemImmune dysregulationMedicineBiologyPathologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In the paper by Wapenaar et al ( see page 10.1136/gut.2007.133132 ) the authors have taken a fascinating approach to identifying shared mechanisms involved in the genesis of either coeliac disease or inflammatory bowel disease (IBD).1 They argue that in these two prototypical inflammatory diseases of the intestinal mucosa there exists reasonable evidence for a defect in barrier function that appears to be required before the development of disease. Furthermore, as both diseases have strong genetic components they speculated that these syndromes might share common genetic defects in the control of intestinal barrier function. They used a genetic association analysis approach and through this identified two adapter protein coding genes that were associated with coeliac disease in patients from both Great Britain and The Netherlands. They went on to demonstrate that one of these genes was also associated with ulcerative colitis in a Dutch patient cohort. These observations are important not only for the conclusions reached in the paper but also in the broader context. Until recently, it was believed that IBD, such as Crohn’s disease, represented dysregulation of the adaptive immune system. Over the past decade, however, there has been increasing recognition of the importance of both epithelial barrier function and innate immunity in the genesis of intestinal inflammation. In the broadest sense these two factors could be argued to be different aspects of the same basic system. Within the gastrointestinal tract there is significant exposure to foreign compounds that can drive systemic inflammation through a variety of mechanisms. The gut has a tremendous number of defence mechanisms that have evolved to manage this ever-changing threat (fig 1). In general terms these include the ability to manage commensal flora in preference to pathogenic organisms, the secretion of toxic molecules such as defensins, the scavenging and binding of luminal organisms by …

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil0,099

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0050,006
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0090,010
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0300,014

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations106
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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