Role for Protein Kinase A in the <i>Neurospora</i> Circadian Clock by Regulating White Collar-Independent <i>frequency</i> Transcription through Phosphorylation of RCM-1
Notice bibliographique
Résumé
Rhythmic activation and repression of clock gene expression is essential for the eukaryotic circadian clock functions. In the Neurospora circadian oscillator, the transcription of the frequency (frq) gene is periodically activated by the White Collar (WC) complex and suppressed by the FRQ-FRH complex. We previously showed that there is WC-independent frq transcription and its repression is required for circadian gene expression. How WC-independent frq transcription is regulated is not known. We show here that elevated protein kinase A (PKA) activity results in WC-independent frq transcription and the loss of clock function. We identified RCM-1 as the protein partner of RCO-1 and an essential component of the clock through its role in suppressing WC-independent frq transcription. RCM-1 is a phosphoprotein and is a substrate of PKA in vivo and in vitro. Mutation of the PKA-dependent phosphorylation sites on RCM-1 results in WC-independent transcription of frq and impaired clock function. Furthermore, we showed that RCM-1 is associated with the chromatin at the frq locus, a process that is inhibited by PKA. Together, our results demonstrate that PKA regulates frq transcription by inhibiting RCM-1 activity through RCM-1 phosphorylation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».