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Enregistrement W2130291509 · doi:10.1034/j.1399-0004.2002.610206.x

<i>ABCA1</i> regulatory variants influence coronary artery disease independent of effects on plasma lipid levels

2002· article· en· W2130291509 sur OpenAlexaff
KY Zwarts, Susanne M. Clee, AH Zwinderman, James C. Engert, Roshni R. Singaraja, Odell Loubser, E. James, Kirsten Roomp, Thomas J. Hudson, J. Wouter Jukema, JJP Kastelein, Michael R. Hayden

Notice bibliographique

RevueClinical Genetics · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCholesterol and Lipid Metabolism
Établissements canadiensXenon Pharmaceuticals (Canada)Montreal General HospitalPacific Centre for Reproductive Medicine
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésABCA1Single-nucleotide polymorphismCoronary artery diseaseSNPTangier diseaseBiologyInternal medicinePopulationCoding regionCholesterolCoronary atherosclerosisGeneticsEndocrinologyGeneMedicineGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The authors have previously shown that individuals heterozygous for ABCA1 mutations have decreased high density lipoprotein cholesterol, increased triglycerides and an increased frequency of coronary artery disease (CAD), and that single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the coding region of the ABCA1 gene significantly impact plasma lipid levels and the severity of CAD in the general population. They have now identified several SNPs in non-coding regions of ABCA1 which may be important for the appropriate regulation of ABCA1 expression (i.e. in the promoter, intron 1 and the 5' untranslated region), and have examined the phenotypic effects of these SNPs in the REGRESS population. Out of 12 SNPs, four were associated with a clinical outcome. A threefold increase in coronary events with an increased family history of CAD was evident for the G-191C variant. Similarly, the C69T SNP was associated with a twofold increase in events. In contrast, the C-17G was associated with a decrease in coronary events and the InsG319 was associated with less atherosclerosis. For all these SNPs, the changes in atherosclerosis and CAD occurred without detectable changes in plasma lipid levels. These data suggest that common variation in non-coding regions of ABCA1 may significantly alter the severity of atherosclerosis, without necessarily influencing plasma lipid levels.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations99
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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