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Enregistrement W2130323672 · doi:10.1139/o07-107

Hydrogen peroxide affects abscisic acid binding to ABAP1 in barley aleurones

2007· article· en· W2130323672 sur OpenAlexaffvenue
Fawzi A. Razem, Robert D. Hill

Dossier post-publication

NatureRetraction
MotifResults Not Reproducible;Unreliable Results and/or Conclusions;
Date12/22/2009 0:00
Signalé par OpenAlex ?Oui

Source : Retraction Watch, jointe par DOI. OpenAlex consigne la rétractation dans is_retracted, un booléen sur un espace d'états à au moins quatre valeurs ; il ne peut donc exprimer ni une expression de préoccupation, ni une correction, ni un rétablissement, et les rapporte comme false, ce qui se lit comme « rien à signaler ».

Notice bibliographique

RevueBiochemistry and Cell Biology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Stress Responses and Tolerance
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAbscisic acidChemistryGuanidineKineticsBiophysicsBiochemistryUreaHydrogen peroxideHydrochlorideAleuroneBinding siteTryptophanStereochemistryAmino acidBiologyEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dramatic increases in H2O2 levels have been observed following abscisic acid (ABA) treatment of plant tissues. Following ABA treatment in aleurone cells, H2O2 reached transient levels of approximately 115 micromol/L H2O2. To determine whether ABA perception was modified by such changes, the effect of H2O2 on a recently characterized ABA-binding protein (ABAP1), cloned from barley aleurone layers, was examined. ABA binding to the protein was weakened by H2O2 in a concentration-dependent manner. A concentration of 75 micromol/L H2O2 gave a 50% decline in ABA binding in a reaction following first-order kinetics, indicative of binding-site susceptibility to its microenvironment. We monitored the unfolding of ABAP1 using steady-state and time-resolved tryptophan fluorescence, while following the capacity of ABAP1 to bind ABA. ABA binding decreased by 50% following ABAP1 denaturation with 1 mol/L guanidine hydrochloride or 2 mol/L urea, while the maximum emission spectra (lambda emi) red shifted from 338 to 347 nm at 3.5 mol/L guanidine hydrochloride and 5 mol/L urea. However, only a slight blue shift of lambda emi was observed following either ABAP1 incubation with H2O2 or binding to (+)-ABA (physiologically active ABA). The equilibrium ABA dissociation rate accelerated in the presence of 250 micromol/L H2O2, with the half-time dissociation reduced to 8 min. A comparison of inactivation kinetics and conformational changes shows that inactivation of ABAP1 occurs before any noticeable conformational change. This suggests that the ABA binding site is highly responsive to its microenvironment and is situated in a region that is more flexible than the protein molecule as a whole. The results demonstrate that H2O2, generated by ABA treatment of aleurone layers, is sufficient to affect the ABA-binding capacity of ABAP1, suggesting that this may be another level of control of ABA signal transduction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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