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Enregistrement W2130366677 · doi:10.1021/bi801773t

Molybdenum Induces the Expression of a Protein Containing a New Heterometallic Mo-Fe Cluster in <i>Desulfovibrio alaskensis</i>

2009· article· en· W2130366677 sur OpenAlexafffund
María G. Rivas, Marta S. P. Carepo, Cristiano Mota, Małgorzata Korbas, Marie-Claire Durand, Ana T. Lopes, Carlos D. Brondino, Alice S. Pereira, Graham N. George, Alain Dolla, José J. G. Moura, Isabel Moura

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineEnergy
ThématiqueMetalloenzymes and iron-sulfur proteins
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesBasic Energy SciencesNational Center for Research ResourcesCanadian Institutes of Health ResearchFundação para a Ciência e a TecnologiaU.S. Department of EnergyConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y TécnicasNational Institutes of HealthUniversity of Saskatchewan
Mots-clésMolybdenumCluster (spacecraft)DesulfovibrioChemistryProtein expressionExpression (computer science)CrystallographyBiochemistryInorganic chemistryComputer scienceOrganic chemistryGeneSulfate

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The characterization of a novel Mo-Fe protein (MorP) associated with a system that responds to Mo in Desulfovibrio alaskensis is reported. Biochemical characterization shows that MorP is a periplasmic homomultimer of high molecular weight (260 +/- 13 kDa) consisting of 16-18 monomers of 15321.1 +/- 0.5 Da. The UV/visible absorption spectrum of the as-isolated protein shows absorption peaks around 280, 320, and 570 nm with extinction coefficients of 18700, 12800, and 5000 M(-1) cm(-1), respectively. Metal content, EXAFS data and DFT calculations support the presence of a Mo-2S-[2Fe-2S]-2S-Mo cluster never reported before. Analysis of the available genomes from Desulfovibrio species shows that the MorP encoding gene is located downstream of a sensor and a regulator gene. This type of gene arrangement, called two component system, is used by the cell to regulate diverse physiological processes in response to changes in environmental conditions. Increase of both gene expression and protein production was observed when cells were cultured in the presence of 45 microM molybdenum. Involvement of this system in Mo tolerance of sulfate reducing bacteria is proposed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,792

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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