MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2130463932 · doi:10.1002/ana.24509

New practical definitions for the diagnosis of autosomal recessive spastic ataxia of <scp>C</scp>harlevoix–<scp>S</scp>aguenay

2015· article· en· W2130463932 sur OpenAlexaboutno aff
Julie Pilliod, Sébastien Moutton, Julie Lavie, Élise Maurat, Christophe Hubert, Nadège Bellancé, Mathieu Anheim, Sylvie Forlani, Fanny Mochel, Karine Nguyen, Christel Thauvin‐Robinet, Christophe Verny, Dan Miléa, Gaëtan Lesca, Michel Kœnig, Diana Rodriguez, Nada Houcinat, Julien Van‐Gils, Christelle Durand, Agnès Guichet, Magalie Barth, Dominique Bonneau, Philippe Convers, Élisabeth Maillart, Lucie Guyant‐Marechal, Didier Hannequin, Guillaume Fromager, Alexandra Afenjar, Sandra Chantot‐Bastaraud, Stéphanie Valence, Perrine Charles, Patrick Berquin, Caroline Rooryck, Julie Bouron, Alexis Brice, Didier Lacombe, Rodrigue Rossignol, Giovanni Stévanin, Giovanni Bénard, Lydie Bürglen, Alexandra Dürr, Cyril Goizet, Isabelle Coupry

Notice bibliographique

RevueAnnals of Neurology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCHIST-ERAAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésMissense mutationAtaxiaGeneticsBiologyExome sequencingMutationGeneNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Autosomal recessive spastic ataxia of Charlevoix-Saguenay (ARSACS) is caused by mutations in the SACS gene. SACS encodes sacsin, a protein whose function remains unknown, despite the description of numerous protein domains and the recent focus on its potential role in the regulation of mitochondrial physiology. This study aimed to identify new mutations in a large population of ataxic patients and to functionally analyze their cellular effects in the mitochondrial compartment. METHODS: A total of 321 index patients with spastic ataxia selected from the SPATAX network were analyzed by direct sequencing of the SACS gene, and 156 patients from the ATAXIC project presenting with congenital ataxia were investigated either by targeted or whole exome sequencing. For functional analyses, primary cultures of fibroblasts were obtained from 11 patients carrying either mono- or biallelic variants, including 1 case harboring a large deletion encompassing the entire SACS gene. RESULTS: We identified biallelic SACS variants in 33 patients from SPATAX, and in 5 nonprogressive ataxia patients from ATAXIC. Moreover, a drastic and recurrent alteration of the mitochondrial network was observed in 10 of the 11 patients tested. INTERPRETATION: Our results permit extension of the clinical and mutational spectrum of ARSACS patients. Moreover, we suggest that the observed mitochondrial network anomalies could be used as a trait biomarker for the diagnosis of ARSACS when SACS molecular results are difficult to interpret (ie, missense variants and heterozygous truncating variant). Based on our findings, we propose new diagnostic definitions for ARSACS using clinical, genetic, and cellular criteria.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,058
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,625
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,058
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,210
Tête enseignante GPT0,364
Écart entre enseignants0,155 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations74
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAnnals of NeurologyMême sujetGenetic Neurodegenerative DiseasesTravaux en français237 207