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Enregistrement W2130476966 · doi:10.1109/isspit.2006.270759

Optimal Filter Design for Multiple Sclerosis Lesions Segmentation from Regions of Interest in Brain MRI

2006· article· en· W2130476966 sur OpenAlexaff
Mohsen Ghazel, Anthony Traboulsee, Rabab Ward

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGene expression and cancer classification
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSegmentationComputer scienceThresholdingArtificial intelligenceRegion of interestFilter (signal processing)Pattern recognition (psychology)Image segmentationScale-space segmentationFeature (linguistics)Multiple sclerosisComputer visionMedicineImage (mathematics)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this paper, we propose an optimal filter design strategy for the purpose of detecting and segmenting MS lesions in prescribed regions of interest within brain MRI data. Reliable segmentation of multiple sclerosis lesions in magnetic resonance brain imaging is important for at least three types of practical applications: pharmaceutical trials, decision making for drug treatment or surgery, and patient follow-up. Manual segmentation of the MS lesions in brain MRI by well qualified experts is usually preferred. However, manual segmentation is hard to reproduce and can be time consuming in the presence of large volumes of MRI data. On the other hand, automated segmentation methods are significantly faster and yield reproducible results. However, these methods generally produce segmentation results that agree only partially with the ground truth segmentation provided by the expert. In this work, we propose a semi-automated MS lesion detection system that combines the knowledge of the expert with the computational capacity to produce faster and more reliable MS segmentation results. In particular, the user selects coarse regions of interest (ROI's) that enclose potential MS lesions and a sufficient background of healthy white matter tissues. Having this two-class classification problem, we propose a feature extraction method based on optimal filter design that aim for producing output texture features corresponding to the MS lesions and healthy tissues background which are maximally separable. If this is achieved, the two output features may be easily separated using simple thresholding operations. The method is applied on real MRI data and the results are qualitatively compared to a ground truth, which is manually segmented by a human expert

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,421
Score d'incertitude au seuil0,254

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,124
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,166 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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