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Enregistrement W2130493310 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-07-1655

Vascular Endothelial Growth Factor Genotypes, Haplotypes, Gender, and the Risk of Non–Small Cell Lung Cancer

2008· article· en· W2130493310 sur OpenAlexaff
Rihong Zhai, Geoffrey Liu, Wei Zhou, Su Li, Rebecca S. Heist, Thomas J. Lynch, John C. Wain, Kofi Asomaning, Xihong Lin, David C. Christiani

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAngiogenesis and VEGF in Cancer
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteMassachusetts General Hospital
Mots-clésHaplotypeOdds ratioGenotypeAdenocarcinomaLung cancerInternal medicineOncologyVascular endothelial growth factorConfidence intervalAngiogenesisRisk factorMetastasisBiologyAdenocarcinoma of the lungMedicineCancerGastroenterologyGeneticsVEGF receptorsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: The vascular endothelial growth factor (VEGF) is a major mediator of angiogenesis involving tumor growth and metastasis. Polymorphisms in the VEGF gene may regulate VEGF production. In this large case-control study, we investigated whether functional polymorphisms (-460C/T, +405C/G, +936C/T) in the VEGF gene are associated with the risk of non-small cell lung cancer (NSCLC). EXPERIMENTAL DESIGN: VEGF genotypes and haplotypes were determined in 1,900 Caucasian patients with NSCLC and 1,458 healthy controls. The results were analyzed using logistic regression models, adjusting for age, gender, smoking status, pack-years of smoking, and years since smoking cessation (for ex-smokers). The false-positive report probability was estimated for the observed odds ratios (OR). RESULTS: There were no overall associations between individual VEGF genotypes and the risk of NSCLC. Stratified analysis suggested that the combined +405CC+CG genotype was significantly associated with increased risk of lung adenocarcinoma in males (adjusted OR, 1.40; 95% confidence interval, 1.03-1.87). In haplotype analysis, haplotypes were globally associated with differences between cases and controls in males (P = 0.03). Specifically, the -460T/+405G/+936C haplotype was significantly (P = 0.02) associated with decreased risk of adenocarcinoma in males when compared with the most common CGC haplotype (adjusted OR, 0.76; 95% confidence interval, 0.50-0.98). None of the VEGF genotypes and haplotypes studied significantly influenced the susceptibility to NSCLC in females. CONCLUSIONS: Polymorphisms of -460C/T, +405C/G, and +936C/T in the VEGF gene do not play a major role in NSCLC risk. However, we could not exclude a minor role for the +405CC+CG genotypes and the 460T/+405G/+936C haplotype in lung adenocarcinogenesis in male Caucasians.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,230
Score d'incertitude au seuil0,493

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,099
Tête enseignante GPT0,407
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations68
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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