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Enregistrement W2130501903 · doi:10.1128/aac.00150-06

Clonal Dissemination of a CTX-M-15 β-Lactamase-Producing <i>Escherichia coli</i> Strain in the Paris Area, Tunis, and Bangui

2006· article· en· W2130501903 sur OpenAlexaboutno aff
Marie Lavollay, Kelthoum Mamlouk, Thierry Frank, A. Akpabie, Béatrice Burghoffer, S. Ben Redjeb, Raymond Bercion, Valérie Gautier, Guillaume Arlet

Notice bibliographique

RevueAntimicrobial Agents and Chemotherapy · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPlasmidEscherichia coliMicrobiologyTypingBiologyclone (Java method)Pulsed-field gel electrophoresisMultilocus sequence typingElectroporationMultiple drug resistanceOutbreakStrain (injury)Molecular epidemiologyGenotypeVirologyGeneticsDrug resistanceGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

One hundred twenty CTX-M-15-producing Escherichia coli strains isolated in 10 different hospitals from Paris (France), in the Hospital Charles Nicolle in Tunis (Tunisia), and in the Pasteur Institute in Bangui, Central African Republic (CAR), between 2000 and 2004 were studied. Eighty isolates, recovered from the three countries, were clonally related by repetitive extragenic palindromic PCR and pulsed-field gel electrophoresis. Various resistance profiles were identified among these clonal strains. After conjugation or electroporation of plasmids from E. coli strains representative of each profile and each geographic region, we observed seven resistance profiles in the recipient strains. Incompatibility typing showed that all the plasmids transferred from the clonal strains studied, except one, belonged to the incompatibility group FII. They all shared a multidrug resistance region (MDR) resembling the MDR region located in pC15-1a, a plasmid associated with an outbreak of a CTX-M-15-producing E. coli strain in Canada. They also shared the common backbone of an apparent mosaic plasmid, including several features present in pC15-1a and in pRSB107, a plasmid isolated from a sewage treatment plant. This study suggests that although the plasmid-borne blaCTX-M-15 gene could be transferred horizontally, its dissemination between France, Tunisia, and CAR was due primarily to its residence in an E. coli clone with a strong propensity for dissemination.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,701
Score d'incertitude au seuil0,435

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations134
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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