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Enregistrement W2130504182 · doi:10.1097/pas.0b013e3181b7ed36

Prospective Evaluation of TLE1 as a Diagnostic Immunohistochemical Marker in Synovial Sarcoma

2009· article· en· W2130504182 sur OpenAlexafffund
Amanda Jagdis, Brian P. Rubin, Raymond R. Tubbs, Marina Pacheco, Torsten O. Nielsen

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Surgical Pathology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSarcoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSynovial sarcomaPathologySarcomaMedicineImmunohistochemistryContext (archaeology)Tissue microarrayCytokeratinBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Synovial sarcoma is a high-grade soft tissue sarcoma that can be challenging to diagnose on the basis of histology alone. It is defined by a characteristic translocation t(X;18) that produces the fusion oncogene SYT-SSX. The current diagnostic gold standard for synovial sarcoma is the demonstration of the translocation by fluorescence in situ hybridization, reverse transcriptase polymerase chain reaction, or cytogenetics, in an appropriate histologic context. TLE1 encodes a transcriptional corepressor that is overexpressed in synovial sarcomas. Gene and tissue microarray studies have identified TLE1 as an excellent bio-marker for distinguishing the synovial sarcoma from other soft tissue malignancies. We prospectively evaluated incoming soft tissue tumor cases where the histology and clinical setting made synovial sarcoma a real consideration in the differential diagnosis. TLE1, Bcl2, epithelial membrane antigen, and cytokeratin expression were assessed using commercially available antibodies. TLE1 gave intense, diffuse nuclear staining in 35 of 35 molecularly confirmed synovial sarcoma cases, and was rare to absent in the 73 other soft tissue tumors examined (positive staining was found only in 1 of 43 malignant peripheral nerve sheath tumors, the 1 tested fibrosarcoma, and 1 pleomorphic sarcoma). TLE1 was more sensitive and specific for synovial sarcoma than other currently available immunohistochemical markers including Bcl2, epithelial membrane antigen and cytokeratins, and had a positive predictive value of 92% and a negative predictive value of 100% in this clinical setting. Our findings confirm, in a prospective diagnostic context, that TLE1 is more sensitive and specific for synovial sarcoma than any other currently available immunohistochemical stains, and in some cases may preclude the need for molecular testing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations166
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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