TANDEM: matching proteins with tandem mass spectra
Pourquoi ce travail est-il dans la base ?
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Résumé
SUMMARY: Tandem mass spectra obtained from fragmenting peptide ions contain some peptide sequence specific information, but often there is not enough information to sequence the original peptide completely. Several proprietary software applications have been developed to attempt to match the spectra with a list of protein sequences that may contain the sequence of the peptide. The application TANDEM was written to provide the proteomics research community with a set of components that can be used to test new methods and algorithms for performing this type of sequence-to-data matching. AVAILABILITY: The source code and binaries for this software are available at http://www.proteome.ca/opensource.html, for Windows, Linux and Macintosh OSX. The source code is made available under the Artistic License, from the authors.
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La notice
- Revue
- Bioinformatics
- Thématique
- Advanced Proteomics Techniques and Applications
- Domaine
- Chemistry
- Établissements canadiens
- University of Manitoba
- Organismes subventionnaires
- Canadian Institutes of Health ResearchUniversity of Chicago
- Mots-clés
- TandemMatching (statistics)Tandem repeatTandem mass spectrometryComputer scienceComputational biologyChemistryBiologyGeneticsMass spectrometryChromatographyMathematicsGenomeStatisticsMaterials science
- Résumé présent dans OpenAlex
- oui