Reconstructing recent divergence: evaluating nonequilibrium population structure in New Zealand chinook salmon
Notice bibliographique
Résumé
Newly established or perturbed populations are often the focus of conservation concerns but they pose special challenges for population genetics because drift-migration equilibrium is unlikely. To advance our understanding of the evolution of such populations, we investigated structure and gene flow among populations of chinook salmon that formed via natural straying following introduction to New Zealand in the early 1900s. We examined 11 microsatellite loci from samples collected in several sites and years to address two questions: (i) what population differentiation has arisen in the approximately 30 generations since salmon were introduced to New Zealand, relative to temporal variation within populations; and (ii) what are the approximate effective population sizes and amounts of gene flow in these populations? These questions are routinely addressed in studies of indigenous populations, but less often in the case of new populations and rarely with consideration of equilibrium assumptions. We show that despite the recent introduction, continued gene flow and high temporal variability among samples, detectable population structure has arisen among the New Zealand populations, consistent with their colonization pattern and isolation by geographical distance. Furthermore, we use simple individual-based simulations and estimates of effective population sizes to estimate the effective gene flow among drainages under likely nonequilibrium conditions. Similar methodology may be broadly applicable to other studies of population structure and phenotypic evolution under similar nonequilibrium, high gene flow conditions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».