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Enregistrement W2130761076 · doi:10.1105/tpc.113.119057

An E4 Ligase Facilitates Polyubiquitination of Plant Immune Receptor Resistance Proteins in <i>Arabidopsis</i> 

2014· article· en· W2130761076 sur OpenAlexafffund
Yan Huang, Sean W. Minaker, Charlotte Roth, Shuai Huang, Philip Hieter, Volker Lipka, Marcel Wiermer, Xin Li

Notice bibliographique

RevueThe Plant Cell · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of British Columbia
Mots-clésUbiquitin ligaseBiologySkp1F-box proteinUbiquitinArabidopsisDDB1Pseudomonas syringaeImmune receptorNPR1MutantArabidopsis thalianaCell biologyProtein degradationUbiquitin-Protein LigasesLeucine-rich repeatGenetic screenReceptorGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Proteins with nucleotide binding and leucine-rich repeat domains (NLRs) serve as immune receptors in animals and plants that recognize pathogens and activate downstream defense responses. As high accumulation of NLRs can result in unwarranted autoimmune responses, their cellular concentrations must be tightly regulated. However, the molecular mechanisms of this process are poorly detailed. The F-box protein Constitutive expressor of PR genes 1 (CPR1) was previously identified as a component of a Skp1, Cullin1, F-box protein E3 complex that targets NLRs, including Suppressor of NPR1, Constitutive 1 (SNC1) and Resistance to Pseudomonas syringae 2 (RPS2), for ubiquitination and further protein degradation. From a forward genetic screen, we identified Mutant, snc1-enhancing 3 (MUSE3), an E4 ubiquitin ligase involved in polyubiquitination of its protein targets. Knocking out MUSE3 in Arabidopsis thaliana results in increased levels of NLRs, including SNC1 and RPS2, whereas overexpressing MUSE3 together with CPR1 enhances polyubiquitination and protein degradation of these immune receptors. This report on the functional role of an E4 ligase in plants provides insight into the scarcely understood NLR degradation pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,085
Score d'incertitude au seuil0,256

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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