A molecular genetic study of autism and related phenotypes in extended pedigrees
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Efforts to uncover the risk genotypes associated with the familial nature of autism spectrum disorder (ASD) have had limited success. The study of extended pedigrees, incorporating additional ASD-related phenotypes into linkage analysis, offers an alternative approach to the search for inherited ASD susceptibility variants that complements traditional methods used to study the genetics of ASD. METHODS: We examined evidence for linkage in 19 extended pedigrees ascertained through ASD cases spread across at least two (and in most cases three) nuclear families. Both compound phenotypes (i.e., ASD and, in non-ASD individuals, the broad autism phenotype) and more narrowly defined components of these phenotypes, e.g., social and repetitive behavior, pragmatic language, and anxiety, were examined. The overarching goal was to maximize the aggregate information available on the maximum number of individuals and to disaggregate syndromic phenotypes in order to examine the genetic underpinnings of more narrowly defined aspects of ASD behavior. RESULTS: Results reveal substantial between-family locus heterogeneity and support the importance of previously reported ASD loci in inherited, familial, forms of ASD. Additional loci, not seen in the ASD analyses, show evidence for linkage to the broad autism phenotype (BAP). BAP peaks are well supported by multiple subphenotypes (including anxiety, pragmatic language, and social behavior) showing linkage to regions overlapping with the compound BAP phenotype. Whereas 'repetitive behavior', showing the strongest evidence for linkage (Posterior Probability of Linkage = 62% at 6p25.2-24.3, and 69% at 19p13.3), appears to be linked to novel regions not detected with other compound or narrow phenotypes examined in this study. CONCLUSIONS: These results provide support for the presence of key features underlying the complexity of the genetic architecture of ASD: substantial between-family locus heterogeneity, that the BAP appears to correspond to sets of subclinical features segregating with ASD within pedigrees, and that different features of the ASD phenotype segregate independently of one another. These findings support the additional study of larger, even more individually informative pedigrees, together with measurement of multiple, behavioral- and biomarker-based phenotypes, in both affected and non-affected individuals, to elucidate the complex genetics of familial ASD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».