64 Nucleus‐encoded, plastid‐targeted glyceraldehyde‐3‐phosphate dehydrogenase (GAPDH) indicates a single origin for chromalveolate plastids
Notice bibliographique
Résumé
Plastids (the photosynthetic organelles of plants and algae) ultimately originated through an endosymbiosis between a cyanobacterium and a eukaryote. Subsequently, plastids spread to other eukaryotes by secondary endosymbioses that took place between a eukaryotic alga and a second eukaryote. Recently, evidence has mounted in favour of a single origin for plastids of apicomplexans, cryptophytes, dinoflagellates, haptophytes, and heterokonts (together with their non‐photosynthetic relatives, collectively termed chromalveolates). As of yet, however, no single molecular marker has been described which supports a common origin for all of these plastids. One piece of the evidence for a single origin of chromalveolate plastids came from plastid‐targeted glyceraldehyde‐3‐phosphate dehydrogenase (GAPDH), which originated by a gene duplication of the cytosolic form. However, no plastid GAPDH has been characterized from haptophytes, leaving an important piece of the puzzle missing. We have sequenced genes encoding cytosolic, mitochondrial‐targeted, and plastid‐targeted GAPDH proteins from a number of haptophytes and heterokonts, and found the haptophyte homologues to branch within the strongly supported clade of chromalveolate plastid‐targeted GAPDH genes. Interestingly, plastid‐targeted GAPDH genes from the haptophytes were more closely related to apicomplexan genes than was expected. Overall, the evolution of plastid‐targeted GAPDH reinforces other data for a red algal ancestry of apicomplexan plastids, and raises a number of questions about the importance of plastid loss and the possibility of cryptic plastids in non‐photosynthetic lineages such as ciliates.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,014 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».