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Enregistrement W2130784814 · doi:10.1128/jvi.00248-08

Identification of a Second CtBP Binding Site in Adenovirus Type 5 E1A Conserved Region 3

2008· article· en· W2130784814 sur OpenAlexafffund
Rachel Bruton, Peter Pelka, Katie L. Mapp, Gregory J. Fonseca, Joseph Torchia, Andrew S. Turnell, Joe S. Mymryk, Roger J.A. Grand

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueKruppel-like factors research
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchBreast Cancer CampaignCancer Research UK
Mots-clésBiologyRepressorBinding siteMolecular biologyPlasma protein bindingConserved sequenceReporter geneCell biologyPeptide sequenceTranscription factorGeneGeneticsGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

C-terminal binding protein (CtBP) binds to adenovirus early region 1A (AdE1A) through a highly conserved PXDLS motif close to the C terminus. We now have demonstrated that CtBP1 also interacts directly with the transcriptional activation domain (conserved region 3 [CR3]) of adenovirus type 5 E1A (Ad5E1A) and requires the integrity of the entire CR3 region for optimal binding. The interaction appears to be at least partially mediated through a sequence ((161)RRNTGDP(167)) very similar to a recently characterized novel CtBP binding motif in ZNF217 as well as other regions of CR3. Using reporter assays, we further demonstrated that CtBP1 represses Ad5E1A CR3-dependent transcriptional activation. Ad5E1A also appears to be recruited to the E-cadherin promoter through its interaction with CtBP. Significantly, Ad5E1A, CtBP1, and ZNF217 form a stable complex which requires CR3 and the PLDLS motif. It has been shown that Ad513SE1A, containing the CR3 region, is able to overcome the transcriptional repressor activity of a ZNF217 polypeptide fragment in a GAL4 reporter assay through recruitment of CtBP1. These results suggest a hitherto-unsuspected complexity in the association of Ad5E1A with CtBP, with the interaction resulting in transcriptional activation by recruitment of CR3-bound factors to CtBP1-containing complexes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,125
Score d'incertitude au seuil0,288

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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