Inferring the past from the present phylogeographic structure of North American forest trees: seeing the forest for the genes
Notice bibliographique
Résumé
The study of past historical events that have led to ecological changes is a recurrent topic in many disciplines. Given that many of these events have left a large and long-lasting evolutionary imprint on the extant population genetic structure of species, phylogeographic studies on modern taxa have been largely used to infer the impacts of these events and to complement previous paleoecological and paleobotanical surveys. In spite of the geographical and geological complexity of North America, converging patterns can be observed when comparing the available genetic data for forest trees. Such patterns include the co-location of genetic discontinuities among species and their coincidence with mountain ranges (e.g., the Appalachians, the Rocky Mountains, the Sierra Nevada, or the Transverse Volcanic Belt) and with previously inferred glacial refugia. Using examples drawn from the available literature, we illustrate such shared features and present the contrasting phylogeographic patterns observed among the different regions of the continent. The various evolutionary consequences of historical events that can be deduced from these phylogeographic studies (e.g., past bottlenecks, founder effects, allopatric divergence, or introgressive hybridization) are additionally discussed. The present challenges and future research prospects that are likely to further advance this field are finally outlined.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».