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Enregistrement W2130870140 · doi:10.1111/j.1095-8312.2012.01878.x

The interplay between habitat availability and population differentiation: a case study on genetic and morphological structure in an inland wader (Charadriiformes)

2012· article· en· W2130870140 sur OpenAlexafffund
Yvonne I. Verkuil, Theunis Piersma, Joop Jukema, Jos C. E. W. Hooijmeijer, Leo Zwarts, Allan J. Baker

Notice bibliographique

RevueBiological Journal of the Linnean Society · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversity of TorontoRoyal Ontario Museum
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyBiological dispersalPanmixiaIsolation by distanceGenetic structureEcologyPopulationCharadriiformesRange (aeronautics)PhylogeographyRefugium (fishkeeping)Gene flowmtDNA control regionGenetic variationHabitatHaplotypeAlleleDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Long-distance migrant waders breeding in the Arctic often have globally structured populations, largely because they were isolated in glacial or interstadial refugia or were restricted to fragmented coastal wetlands in winter. Conversely, inland species using continentally distributed wetlands appear to be less structured (more often panmictic), presumably because they are less likely to have been isolated by multiple refugia or by current events. We analyzed genetic variation in a widely distributed inland species, the ruff (Philomachus pugnax), sampled from seven Eurasian breeding localities, and from migration routes and wintering areas in Europe and Africa. One mitochondrial marker (N = 118) and eight nuclear microsatellites (N = 170) showed: (1) high genetic variation; (2) large genetic distances among mitochondrial (private) haplotypes within breeding populations; (3) the absence of a signature of isolation-by-distance; and (4) a distribution of private microsatellite alleles indicating dispersal between Scandinavia and Siberia but not between western and eastern Siberia. These results were consistent with a large refugial population during the Last Glacial Maximum, and postglacial long range expansions spreading ancestral polymorphisms, and not with a stepping-stone model of gene flow. The divergence between breeding populations in Europe and Siberia was dated to approximately 12 000 years ago. Although genetic population structure is presently statistically non-existent, support for evolving population structure came from analyses of geographical variation in two relevant phenotypic traits: wing length and the timing of migration. Analysis of 6077 individuals sampled on migration in 2002–08 revealed that, in each year, shorter-winged birds migrated through significantly later than longer-winged birds. The late-passing birds were associated with more westerly breeding localities. In conclusion, the lack of genetic structuring in ruffs (and other inland species we examined) contrasts with strong structuring in many coastal species. This suggests that the ability to use more widely available inland habitat influences the evolution of genetic structure and the maintenance of genetic variation in waders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,039

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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