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Enregistrement W2130988531 · doi:10.3899/jrheum.100728

Functional Polymorphisms of the Coagulation Factor II Gene (<i>F2</i>) and Susceptibility to Systemic Lupus Erythematosus

2011· article· en· W2130988531 sur OpenAlexvenueno aff
F. Yesim Demirci, Amy Dressen, Candace M. Kammerer, M. Michael Barmada, Amy Kao, Rosalind Ramsey‐Goldman, Susan Manzi, M. Ilyas Kamboh

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Rheumatology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood Coagulation and Thrombosis Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesNational Heart, Lung, and Blood Institute
Mots-clésMedicineInternal medicineOdds ratioAlleleGastroenterologyLupus anticoagulantImmunologyLupus erythematosusVenous thrombosisAllele frequencyRisk factorThrombosisAntibodyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Two F2 functional polymorphisms, rs1799963 (G20210A) and rs3136516 (A19911G), are known to be associated with elevated levels/activity of prothrombin (encoded by F2) and risk of thrombosis. Since patients with systemic lupus erythematosus (SLE) have high risk of thrombosis and accelerated atherosclerosis and also high prevalence of anti-prothrombin antibodies, we hypothesized that these two F2 polymorphisms could affect risk of SLE. METHODS: We investigated these polymorphisms in 627 women with SLE (84% Caucasian Americans, 16% African Americans) and 657 female controls (78% Caucasian Americans, 22% African Americans). RESULTS: While the rs1799963 A allele was almost absent in African Americans, it was present at ~2% frequency in Caucasian Americans and showed no significant association with SLE. The rs3136516 G allele frequency was significantly higher in Caucasian SLE cases than in controls (48.4% vs 43.7%, respectively) with a covariate-adjusted odds ratio (OR) of 1.22 (95% CI 1.03-1.46, p = 0.023). The association was replicated in African Americans (rs3136516 G allele frequency 91.2% in cases vs 82.2% in controls) with an adjusted OR of 1.96 (95% CI 1.08-3.58, p = 0.022). Stratification of Caucasian SLE patients based on the presence or absence of cardiac and vascular events (CVE) revealed stronger association with the CVE-positive SLE subgroup than the CVE-negative SLE subgroup (OR 1.42 vs 1.20). Prothrombin activity measurements in a subset of SLE cases demonstrated higher activity in the carriers of the rs3136516 G allele. CONCLUSION: Our results suggest a potential role for prothrombin and the crosstalk between hemostatic and immune/inflammatory systems in SLE and SLE-associated cardiovascular events, which warrants further investigation in independent samples.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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