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Enregistrement W2130998817 · doi:10.1186/1743-422x-6-68

The directionality of the nuclear transport of the influenza A genome is driven by selective exposure of nuclear localization sequences on nucleoprotein

2009· article· en· W2130998817 sur OpenAlexafffund
Winco W.H. Wu, Nelly Panté

Notice bibliographique

RevueVirology Journal · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchMichael Smith Health Research BC
Mots-clésNuclear transportBiologyNuclear export signalRibonucleoproteinNucleoproteinCell nucleusSmall nuclear ribonucleoproteinVirologyCell biologyKaryopherinNuclear poreNucleusCytoplasmNuclear localization sequenceMolecular biologyHeterogeneous nuclear ribonucleoproteinVirusRNAGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Early in infection, the genome of the influenza A virus, consisting of eight complexes of RNA and proteins (termed viral ribonucleoproteins; vRNPs), enters the nucleus of infected cells for replication. Incoming vRNPs are imported into the nucleus of infected cells using at least two nuclear localization sequences on nucleoprotein (NP; NLS1 at the N terminus, and NLS2 in the middle of the protein). Progeny vRNP assembly occurs in the nucleus, and later in infection, these are exported from the nucleus to the cytoplasm. Nuclear-exported vRNPs are different from incoming vRNPs in that they are prevented from re-entering the nucleus. Why nuclear-exported vRNPs do not re-enter the nucleus is unknown. RESULTS: To test our hypothesis that the exposure of NLSs on the vRNP regulates the directionality of the nuclear transport of the influenza vRNPs, we immunolabeled the two NLSs of NP (NLS1 and NLS2) and analyzed their surface accessibility in cells infected with the influenza A virus. We found that the NLS1 epitope on NP was exposed throughout the infected cells, but the NLS2 epitope on NP was only exposed in the nucleus of the infected cells. Addition of the nuclear export inhibitor leptomycin B further revealed that NLS1 is no longer exposed in cytoplasmic NP and vRNPs that have already undergone nuclear export. Similar immunolabeling studies in the presence of leptomycin B and with cells transfected with the cDNA of NP revealed that the NLS1 on NP is hidden in nuclear exported-NP. CONCLUSION: NLS1 mediates the nuclear import of newly-synthesized NP and incoming vRNPs. This NLS becomes hidden on nuclear-exported NP and nuclear-exported vRNPs. Thus the selective exposure of the NLS1 constitutes a critical mechanism to regulate the directionality of the nuclear transport of vRNPs during the influenza A viral life cycle.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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