Creating Bioinformatics Semantic Web Services from Existing Web Services: A Real-World Application of SAWSDL
Notice bibliographique
Résumé
Semantic annotations for WSDL (SAWSDL) is a recently adopted W3C recommendation that provides a mechanism by which WSDL documents can reference external, domain-specific semantic models in order to provide concept-level interoperability of Web Services. Moby is an established protocol for providing semantic Web Services developed by the bioinformatics community: we use Moby to provide a grounding for a SAWSDL implementation in bioinformatics. Our software (Daggoo) allows users to create Moby-compliant semantic Web Services by simply adding SAWSDL markup to existing WSDL files. These new services are compatible with existing Moby services and client software. The Java software we present consists of a proxy servlet, a URI-resolution mechanism, and rule systems for converting back and forth between Moby and XML Schema data formats. As an early implementation of SAWSDL, Daggoo reveals shortcomings in the notation, and several additional technologies needed to achieve real-world semantic interoperability of WSDL-based services. Based on our experience, we suggest how to improve the semantic annotation mechanism, and how to reduce the programming burden for individual service providers. Furthermore, we demonstrate the importance of a semantically-enabled registry for services and data types in facilitating scientist-driven, rather than programmer-driven, Web service choreography.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,007 | 0,008 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,002 |
| Communication savante | 0,004 | 0,005 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».