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Enregistrement W2131033800 · doi:10.1074/mcp.m110.000349

Comparative Proteomics Indicates That Biosynthesis of Pectic Precursors Is Important for Cotton Fiber and Arabidopsis Root Hair Elongation

2010· article· en· W2131033800 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueMolecular & Cellular Proteomics · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueResearch in Cotton Cultivation
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaHigher Education Discipline Innovation ProjectNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésPectinCell wallBiochemistrySecondary cell wallArabidopsisArabinoseRoot hairMutantHemicelluloseGibberellic acidElongationBiologyChemistryBotanyXyloseCelluloseGeneFermentationGermination

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The quality of cotton fiber is determined by its final length and strength, which is a function of primary and secondary cell wall deposition. Using a comparative proteomics approach, we identified 104 proteins from cotton ovules 10 days postanthesis with 93 preferentially accumulated in the wild type and 11 accumulated in the fuzzless-lintless mutant. Bioinformatics analysis indicated that nucleotide sugar metabolism was the most significantly up-regulated biochemical process during fiber elongation. Seven protein spots potentially involved in pectic cell wall polysaccharide biosynthesis were specifically accumulated in wild-type samples at both the protein and transcript levels. Protein and mRNA expression of these genes increased when either ethylene or lignoceric acid (C24:0) was added to the culture medium, suggesting that these compounds may promote fiber elongation by modulating the production of cell wall polymers. Quantitative analysis revealed that fiber primary cell walls contained significantly higher amounts of pectin, whereas more hemicellulose was found in ovule samples. Significant fiber growth was observed when UDP-L-rhamnose, UDP-D-galacturonic acid, or UDP-D-glucuronic acid, all of which were readily incorporated into the pectin fraction of cell wall preparations, was added to the ovule culture medium. The short root hairs of Arabidopsis uer1-1 and gae6-1 mutants were complemented either by genetic transformation of the respective cotton cDNA or by adding a specific pectin precursor to the growth medium. When two pectin precursors, produced by either UDP-4-keto-6-deoxy-D-glucose 3,5-epimerase 4-reductase or by UDP-D-glucose dehydrogenase and UDP-D-glucuronic acid 4-epimerase successively, were used in the chemical complementation assay, wild-type root hair lengths were observed in both cut1 and ein2-5 Arabidopsis seedlings, which showed defects in C24:0 biosynthesis or ethylene signaling, respectively. Our results suggest that ethylene and C24:0 may promote cotton fiber and Arabidopsis root hair growth by activating the pectin biosynthesis network, especially UDP-L-rhamnose and UDP-D-galacturonic acid synthesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,518

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle