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Enregistrement W2131056893 · doi:10.1099/vir.0.19610-0

Characterization of human herpesvirus 6 variant B immediate-early 1 protein modifications by small ubiquitin-related modifiers

2004· article· en· W2131056893 sur OpenAlexafffund
Annie Gravel, Valérie Dion, Nathalie Cloutier, Jean Gosselin, Louis Flamand

Notice bibliographique

RevueJournal of General Virology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSUMO proteinTransactivationBiologyTransfectionUbiquitinPhosphoserineLysineMutantCell biologyMolecular biologyTranscription factorPhosphorylationBiochemistryGeneSerineAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The human herpesvirus 6 (HHV-6) immediate-early (IE) 1 protein undergoes SUMOylation events during the infectious process. In the present work, we report that Lys-802 (K-802) of IE1 from HHV-6 variant B is the only target residue capable of conjugation to SUMO-1/SMT3C/Sentrin-1, SUMO-2/SMT3A/Sentrin-3 or SUMO-3/SMT3B/Sentrin-2 as determined by transfection and in vitro SUMOylation experiments. PolySUMOylated forms of IE1 were also observed, suggesting that SUMO branching occurs at the K-802 residue. Overexpression of SUMO-1, -2 and -3 led to an overall increase in IE1 levels, irrespective of K-802. The SUMO residues could be efficiently removed by incubating SUMOylated IE1 with SENP1, a recently identified SUMO peptidase. SUMOylation-deficient mutants of IE1 co-localized with nuclear promyelocytic leukaemia protein (PML) oncogenic domains (PODs) as efficiently as WT IE1, indicating that POD targeting is independent of IE1 SUMOylation status. However, in contrast to infection, PODs did not aggregate in IE1B-transfected cells, suggesting that other viral proteins are involved in the process. Transactivation studies indicated that IE1, in combination with IE2, could efficiently transactivate diverse promoters, independent of its SUMOylation status. Overall, the results presented provide a detailed biochemical characterization of post-translational modifications of the HHV-6 IE1 protein by SUMO peptides, contributing to our understanding of the complex interactions between herpesviruses and the SUMO-conjugation pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,616

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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