MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2131073827 · doi:10.1002/jcb.24528

Control of <i>Fiat</i> (factor inhibiting ATF4‐mediated transcription) expression by Sp family transcription factors in osteoblasts

2013· article· en· W2131073827 sur OpenAlexaff
Bahareh Hekmatnejad, Claude Gauthier, René St‐Arnaud

Notice bibliographique

RevueJournal of Cellular Biochemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensMcGill UniversityShriners Hospitals for Children - Canada
Organismes subventionnairesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesNational Institutes of Health
Mots-clésGene knockdownTranscription factorPromoterOsteocalcinTranscription (linguistics)ATF4Activator (genetics)TransfectionMolecular biologySp1 transcription factorReporter geneLuciferaseCell biologyGene expressionChemistryBiologyGeneBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

FIAT (factor inhibiting ATF4-mediated transcription) represses Osteocalcin gene transcription and inhibits osteoblast activity by heterodimerizing with ATF4 to prevent it from binding DNA. It thus appears important to identify and characterize the molecular mechanisms that control Fiat gene expression in osteoblasts. In silico sequence analysis identified a canonical GC-box within a 1,400 bp region of the proximal Fiat gene promoter. Electrophoretic mobility shift assays (EMSA) with MC3T3-E1 osteoblastic cells nuclear extracts indicated that the transcription factors Sp1 and Sp3, but not Sp7/OSTERIX, bound this proximal GC-box. Chromatin immunoprecipitation confirmed interaction of the two transcription factors with the Fiat promoter GC-element in living osteoblasts. Transient transfection studies showed that Sp1 dose-dependently activated the expression of a Fiat-luciferase reporter construct while both the long or short isoforms of Sp3 dose-dependently inhibited transcription from the Fiat reporter construct. Transfection of an Sp7/OSTERIX expression vector did not affect expression of the Fiat-luciferase reporter. Co-transfection of increasing amounts of the Sp3 expression vector in the context of maximal Sp1-dependent Fiat-luciferase activation led to dose-dependent repression of the expression of the reporter. Using RNA knockdown, we measured a reduction in steady-state Fiat expression when Sp1 was inhibited, and a reciprocal increase upon Sp3 knockdown. In parallel, treatment of osteoblasts with WP631, which prevents Sp1/DNA interactions, strongly inhibited the expression of Fiat and reduced the occupancy of the Fiat promoter proximal GC-box by Sp1. Taken together, our results suggest an interplay between Sp1 and Sp3 as a mechanism involved in the control of Fiat gene expression in osteoblasts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,833

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Cellular BiochemistryMême sujetRNA Research and SplicingTravaux en français237 207