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Enregistrement W2131150338

CFH Y402H polymorphism is associated with elevated vitreal GM-CSF and choroidal macrophages in the postmortem human eye.

2015· article· en· W2131150338 sur OpenAlexaff
Jay Ching Chieh Wang, Sijia Cao, Aikun Wang, Eleanor To, Geoffrey Law, Jiangyuan Gao, Dean Zhang, Jing Cui, Joanne A. Matsubara

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRetinal Diseases and Treatments
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFactor HMacular degenerationChoroidSingle-nucleotide polymorphismCD68GenotypeComplement factor IPathologyBiologyMedicineComplement systemImmunologyImmunohistochemistryRetinaOphthalmologyAntibodyGeneticsGene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Age-related macular degeneration (AMD) is the leading cause of irreversible blindness in people 50 years of age or older in developed countries. The homozygous CC genotype in the complement factor H (CFH) Y402H single nucleotide polymorphism (SNP; rs1061170) is widely recognized as a risk factor for the development of AMD. In this study, we examined vitreal levels of granulocyte macrophage colony-stimulating factor (GM-CSF), a hematopoietic cytokine, and macrophages in the choroid of postmortem human eyes genotyped for the CFH Y402H SNP. METHODS: Twenty-two pairs of postmortem, non-diseased, human donor eyes were obtained. The vitreous and retinal tissues of the left eyes were collected for GM-CSF level measurement and CFH Y402H genotyping, respectively. The right eyes were paraffin-embedded and sectioned for immunohistochemistry using a macrophage and microglia marker, CD68. Cell cultures of RPE cells were stimulated with complement C3a, C5a, 4-hydroxynonenal (HNE), or tumor necrosis factor alpha (TNF-α), and GM-CSF expression was measured with a suspension assay or quantitative PCR. RESULTS: Eyes genotyped with the CC or the CT risk variant of the CFH Y402H SNP showed significantly increased levels of GM-CSF in the vitreous compared to eyes with the protective TT variant (mean ± standard error of mean, 607.54±85.83 pg/ml or 656.32±15.20 pg/ml versus 286.69±81.96 pg/ml, p<0.05). The choroid of eye tissues genotyped with the CC variant showed higher levels of CD68 immunoreactivity than the tissues genotyped with the TT variant (p<0.05). The GM-CSF levels detected in the supernatant of RPE cells in culture treated with HNE or TNF-α were significantly higher compared to the non-treated control (145.88±5.06 pg/ml and 149.32±3.76 pg/ml versus 123.27±4.05 pg/ml, p<0.05). Furthermore, the gene expression of GM-CSF detected in the lysate of RPE cells stimulated with complement C3a or C5a showed significantly increased fold changes compared to the non-treated control (C3a: 2.38±0.31 fold, p<0.05; C5a: 2.84±0.54 fold, p<0.01). CONCLUSIONS: Our data showed a relationship between the CFH Y402H polymorphism and GM-CSF levels in the vitreous and accumulation of choroidal macrophages in the postmortem eye. These data suggest that the at-risk variant of the CFH gene may contribute to the dysregulation of proinflammatory cytokines locally in the eye.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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